Protein–RNA interactions for Protein: P17693

HLA-G, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain G, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-GP17693 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-GP17693 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-GP17693 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-GP17693 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-GP17693 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-GP17693 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-GP17693 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-GP17693 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-GP17693 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-GP17693 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-GP17693 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-GP17693 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-GP17693 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-GP17693 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-GP17693 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-GP17693 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-GP17693 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-GP17693 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-GP17693 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-GP17693 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-GP17693 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-GP17693 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-GP17693 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-GP17693 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-GP17693 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-GP17693 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-GP17693 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-GP17693 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-GP17693 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-GP17693 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-GP17693 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-GP17693 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-GP17693 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-GP17693 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-GP17693 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-GP17693 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-GP17693 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-GP17693 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-GP17693 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-GP17693 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-GP17693 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-GP17693 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-GP17693 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-GP17693 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-GP17693 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-GP17693 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-GP17693 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-GP17693 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-GP17693 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-GP17693 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-GP17693 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-GP17693 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-GP17693 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-GP17693 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-GP17693 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-GP17693 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-GP17693 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-GP17693 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-GP17693 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-GP17693 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-GP17693 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-GP17693 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-GP17693 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-GP17693 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-GP17693 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-GP17693 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-GP17693 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-GP17693 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-GP17693 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-GP17693 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-GP17693 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-GP17693 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-GP17693 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-GP17693 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-GP17693 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-GP17693 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-GP17693 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-GP17693 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-GP17693 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms