Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCAP17252 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCAP17252 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCAP17252 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCAP17252 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCAP17252 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCAP17252 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCAP17252 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCAP17252 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCAP17252 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCAP17252 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCAP17252 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCAP17252 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCAP17252 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCAP17252 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCAP17252 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCAP17252 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCAP17252 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCAP17252 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCAP17252 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCAP17252 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCAP17252 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCAP17252 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCAP17252 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCAP17252 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCAP17252 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCAP17252 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCAP17252 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCAP17252 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCAP17252 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCAP17252 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCAP17252 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCAP17252 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCAP17252 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCAP17252 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCAP17252 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCAP17252 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCAP17252 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCAP17252 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCAP17252 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCAP17252 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCAP17252 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCAP17252 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCAP17252 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCAP17252 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKCAP17252 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCAP17252 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCAP17252 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCAP17252 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCAP17252 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCAP17252 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCAP17252 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCAP17252 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCAP17252 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCAP17252 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCAP17252 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCAP17252 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCAP17252 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCAP17252 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCAP17252 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKCAP17252 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKCAP17252 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCAP17252 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCAP17252 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCAP17252 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCAP17252 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCAP17252 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCAP17252 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCAP17252 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCAP17252 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCAP17252 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKCAP17252 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCAP17252 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCAP17252 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCAP17252 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCAP17252 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCAP17252 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCAP17252 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCAP17252 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCAP17252 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms