Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
GLI3P10071 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
GLI3P10071 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
GLI3P10071 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
GLI3P10071 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
GLI3P10071 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
GLI3P10071 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
GLI3P10071 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
GLI3P10071 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GLI3P10071 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GLI3P10071 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GLI3P10071 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
GLI3P10071 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
GLI3P10071 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
GLI3P10071 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
GLI3P10071 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
GLI3P10071 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GLI3P10071 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GLI3P10071 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
GLI3P10071 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
GLI3P10071 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
GLI3P10071 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.99■■■■□ 3.51
GLI3P10071 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
GLI3P10071 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
GLI3P10071 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
GLI3P10071 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
GLI3P10071 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
GLI3P10071 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
GLI3P10071 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
GLI3P10071 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
GLI3P10071 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
GLI3P10071 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GLI3P10071 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GLI3P10071 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GLI3P10071 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
GLI3P10071 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
GLI3P10071 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GLI3P10071 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
GLI3P10071 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GLI3P10071 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GLI3P10071 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GLI3P10071 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
GLI3P10071 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
GLI3P10071 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
GLI3P10071 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GLI3P10071 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
GLI3P10071 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
GLI3P10071 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
GLI3P10071 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
GLI3P10071 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
GLI3P10071 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
GLI3P10071 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
GLI3P10071 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
GLI3P10071 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
GLI3P10071 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
GLI3P10071 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
GLI3P10071 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
GLI3P10071 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
GLI3P10071 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
GLI3P10071 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
GLI3P10071 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
GLI3P10071 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
GLI3P10071 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
GLI3P10071 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
GLI3P10071 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
GLI3P10071 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
GLI3P10071 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
GLI3P10071 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
GLI3P10071 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
GLI3P10071 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
GLI3P10071 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
GLI3P10071 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
GLI3P10071 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
GLI3P10071 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
GLI3P10071 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
GLI3P10071 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.58■■■■□ 3.45
GLI3P10071 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
GLI3P10071 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
GLI3P10071 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
GLI3P10071 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GLI3P10071 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GLI3P10071 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GLI3P10071 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GLI3P10071 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
GLI3P10071 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
GLI3P10071 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
GLI3P10071 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
GLI3P10071 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
GLI3P10071 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
GLI3P10071 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GLI3P10071 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GLI3P10071 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
GLI3P10071 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GLI3P10071 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
GLI3P10071 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GLI3P10071 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GLI3P10071 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GLI3P10071 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
GLI3P10071 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
GLI3P10071 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms