Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX4

SMIM18, Small integral membrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM18P0DKX4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMIM18P0DKX4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMIM18P0DKX4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM18P0DKX4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM18P0DKX4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM18P0DKX4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM18P0DKX4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM18P0DKX4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM18P0DKX4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM18P0DKX4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM18P0DKX4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM18P0DKX4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM18P0DKX4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM18P0DKX4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM18P0DKX4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM18P0DKX4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM18P0DKX4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM18P0DKX4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM18P0DKX4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM18P0DKX4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM18P0DKX4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM18P0DKX4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM18P0DKX4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM18P0DKX4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM18P0DKX4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM18P0DKX4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM18P0DKX4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM18P0DKX4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM18P0DKX4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM18P0DKX4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM18P0DKX4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM18P0DKX4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM18P0DKX4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM18P0DKX4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM18P0DKX4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM18P0DKX4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM18P0DKX4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM18P0DKX4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM18P0DKX4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM18P0DKX4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM18P0DKX4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM18P0DKX4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMIM18P0DKX4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM18P0DKX4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM18P0DKX4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM18P0DKX4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM18P0DKX4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM18P0DKX4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM18P0DKX4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM18P0DKX4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM18P0DKX4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM18P0DKX4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM18P0DKX4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM18P0DKX4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM18P0DKX4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM18P0DKX4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM18P0DKX4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM18P0DKX4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM18P0DKX4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM18P0DKX4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM18P0DKX4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM18P0DKX4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM18P0DKX4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM18P0DKX4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM18P0DKX4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM18P0DKX4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM18P0DKX4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM18P0DKX4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM18P0DKX4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM18P0DKX4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM18P0DKX4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM18P0DKX4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM18P0DKX4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM18P0DKX4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM18P0DKX4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM18P0DKX4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM18P0DKX4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM18P0DKX4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM18P0DKX4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM18P0DKX4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM18P0DKX4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM18P0DKX4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM18P0DKX4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM18P0DKX4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM18P0DKX4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM18P0DKX4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM18P0DKX4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM18P0DKX4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM18P0DKX4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM18P0DKX4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM18P0DKX4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM18P0DKX4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM18P0DKX4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM18P0DKX4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM18P0DKX4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM18P0DKX4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM18P0DKX4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM18P0DKX4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM18P0DKX4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM18P0DKX4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms