Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACAA1P09110 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACAA1P09110 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACAA1P09110 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACAA1P09110 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACAA1P09110 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACAA1P09110 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACAA1P09110 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACAA1P09110 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACAA1P09110 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACAA1P09110 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACAA1P09110 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACAA1P09110 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACAA1P09110 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACAA1P09110 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACAA1P09110 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACAA1P09110 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACAA1P09110 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACAA1P09110 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACAA1P09110 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACAA1P09110 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACAA1P09110 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACAA1P09110 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACAA1P09110 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACAA1P09110 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACAA1P09110 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACAA1P09110 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACAA1P09110 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACAA1P09110 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACAA1P09110 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACAA1P09110 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACAA1P09110 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAA1P09110 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAA1P09110 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAA1P09110 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACAA1P09110 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACAA1P09110 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACAA1P09110 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAA1P09110 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAA1P09110 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAA1P09110 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAA1P09110 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAA1P09110 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAA1P09110 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAA1P09110 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACAA1P09110 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACAA1P09110 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACAA1P09110 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACAA1P09110 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACAA1P09110 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACAA1P09110 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACAA1P09110 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACAA1P09110 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACAA1P09110 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACAA1P09110 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACAA1P09110 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACAA1P09110 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACAA1P09110 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACAA1P09110 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACAA1P09110 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACAA1P09110 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACAA1P09110 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACAA1P09110 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACAA1P09110 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACAA1P09110 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACAA1P09110 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACAA1P09110 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACAA1P09110 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACAA1P09110 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACAA1P09110 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACAA1P09110 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACAA1P09110 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACAA1P09110 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACAA1P09110 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACAA1P09110 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACAA1P09110 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACAA1P09110 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACAA1P09110 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACAA1P09110 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACAA1P09110 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACAA1P09110 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACAA1P09110 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACAA1P09110 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACAA1P09110 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACAA1P09110 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACAA1P09110 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACAA1P09110 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACAA1P09110 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACAA1P09110 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACAA1P09110 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACAA1P09110 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACAA1P09110 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACAA1P09110 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms