Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SYPP08247 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYPP08247 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYPP08247 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYPP08247 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYPP08247 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYPP08247 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYPP08247 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SYPP08247 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYPP08247 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYPP08247 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYPP08247 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYPP08247 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYPP08247 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SYPP08247 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYPP08247 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYPP08247 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYPP08247 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYPP08247 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYPP08247 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYPP08247 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYPP08247 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYPP08247 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYPP08247 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYPP08247 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYPP08247 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYPP08247 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYPP08247 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SYPP08247 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYPP08247 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYPP08247 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYPP08247 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYPP08247 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYPP08247 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYPP08247 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYPP08247 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYPP08247 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYPP08247 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYPP08247 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYPP08247 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYPP08247 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYPP08247 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYPP08247 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYPP08247 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYPP08247 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYPP08247 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYPP08247 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYPP08247 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYPP08247 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYPP08247 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYPP08247 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYPP08247 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYPP08247 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYPP08247 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYPP08247 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYPP08247 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYPP08247 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYPP08247 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SYPP08247 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYPP08247 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYPP08247 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SYPP08247 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYPP08247 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYPP08247 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYPP08247 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYPP08247 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYPP08247 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYPP08247 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYPP08247 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYPP08247 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYPP08247 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYPP08247 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYPP08247 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYPP08247 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYPP08247 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYPP08247 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYPP08247 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYPP08247 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYPP08247 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYPP08247 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYPP08247 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYPP08247 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYPP08247 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYPP08247 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYPP08247 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYPP08247 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYPP08247 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SYPP08247 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SYPP08247 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYPP08247 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYPP08247 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYPP08247 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYPP08247 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYPP08247 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYPP08247 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SYPP08247 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYPP08247 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYPP08247 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYPP08247 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYPP08247 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms