Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
COL2A1P02458 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
COL2A1P02458 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
COL2A1P02458 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
COL2A1P02458 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.77
COL2A1P02458 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
COL2A1P02458 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
COL2A1P02458 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
COL2A1P02458 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
COL2A1P02458 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
COL2A1P02458 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
COL2A1P02458 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
COL2A1P02458 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
COL2A1P02458 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
COL2A1P02458 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
COL2A1P02458 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
COL2A1P02458 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
COL2A1P02458 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
COL2A1P02458 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
COL2A1P02458 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
COL2A1P02458 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
COL2A1P02458 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
COL2A1P02458 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
COL2A1P02458 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
COL2A1P02458 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
COL2A1P02458 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
COL2A1P02458 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
COL2A1P02458 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
COL2A1P02458 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
COL2A1P02458 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
COL2A1P02458 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
COL2A1P02458 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
COL2A1P02458 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL2A1P02458 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL2A1P02458 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL2A1P02458 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
COL2A1P02458 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
COL2A1P02458 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
COL2A1P02458 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL2A1P02458 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL2A1P02458 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
COL2A1P02458 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL2A1P02458 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL2A1P02458 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL2A1P02458 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL2A1P02458 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
COL2A1P02458 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
COL2A1P02458 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
COL2A1P02458 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
COL2A1P02458 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
COL2A1P02458 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
COL2A1P02458 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
COL2A1P02458 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
COL2A1P02458 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
COL2A1P02458 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
COL2A1P02458 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
COL2A1P02458 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
COL2A1P02458 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
COL2A1P02458 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
COL2A1P02458 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
COL2A1P02458 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
COL2A1P02458 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
COL2A1P02458 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
COL2A1P02458 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
COL2A1P02458 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
COL2A1P02458 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
COL2A1P02458 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
COL2A1P02458 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
COL2A1P02458 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
COL2A1P02458 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
COL2A1P02458 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
COL2A1P02458 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
COL2A1P02458 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
COL2A1P02458 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
COL2A1P02458 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
COL2A1P02458 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
COL2A1P02458 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
COL2A1P02458 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
COL2A1P02458 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
COL2A1P02458 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
COL2A1P02458 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
COL2A1P02458 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
COL2A1P02458 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
COL2A1P02458 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
COL2A1P02458 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
COL2A1P02458 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
COL2A1P02458 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
COL2A1P02458 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
COL2A1P02458 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
COL2A1P02458 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
COL2A1P02458 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
COL2A1P02458 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
COL2A1P02458 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
COL2A1P02458 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
COL2A1P02458 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
COL2A1P02458 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
COL2A1P02458 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
COL2A1P02458 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
COL2A1P02458 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
COL2A1P02458 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms