Protein–RNA interactions for Protein: P01817

IGHV2-5, Immunoglobulin heavy variable 2-5, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV2-5P01817 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV2-5P01817 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV2-5P01817 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV2-5P01817 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV2-5P01817 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV2-5P01817 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV2-5P01817 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV2-5P01817 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV2-5P01817 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV2-5P01817 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV2-5P01817 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV2-5P01817 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV2-5P01817 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV2-5P01817 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV2-5P01817 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV2-5P01817 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV2-5P01817 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV2-5P01817 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV2-5P01817 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV2-5P01817 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV2-5P01817 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV2-5P01817 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV2-5P01817 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV2-5P01817 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV2-5P01817 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV2-5P01817 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV2-5P01817 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV2-5P01817 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV2-5P01817 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV2-5P01817 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV2-5P01817 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV2-5P01817 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV2-5P01817 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV2-5P01817 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV2-5P01817 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGHV2-5P01817 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV2-5P01817 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV2-5P01817 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV2-5P01817 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV2-5P01817 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV2-5P01817 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV2-5P01817 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV2-5P01817 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV2-5P01817 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV2-5P01817 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV2-5P01817 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV2-5P01817 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV2-5P01817 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV2-5P01817 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV2-5P01817 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV2-5P01817 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV2-5P01817 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV2-5P01817 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV2-5P01817 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGHV2-5P01817 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV2-5P01817 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV2-5P01817 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV2-5P01817 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHV2-5P01817 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV2-5P01817 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV2-5P01817 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV2-5P01817 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV2-5P01817 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV2-5P01817 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV2-5P01817 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV2-5P01817 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHV2-5P01817 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV2-5P01817 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV2-5P01817 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV2-5P01817 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV2-5P01817 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV2-5P01817 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV2-5P01817 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV2-5P01817 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms