Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
APBA3O96018 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
APBA3O96018 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
APBA3O96018 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
APBA3O96018 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
APBA3O96018 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
APBA3O96018 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
APBA3O96018 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
APBA3O96018 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
APBA3O96018 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
APBA3O96018 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
APBA3O96018 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
APBA3O96018 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
APBA3O96018 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
APBA3O96018 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
APBA3O96018 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
APBA3O96018 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
APBA3O96018 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
APBA3O96018 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
APBA3O96018 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
APBA3O96018 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
APBA3O96018 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
APBA3O96018 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
APBA3O96018 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
APBA3O96018 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
APBA3O96018 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
APBA3O96018 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
APBA3O96018 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
APBA3O96018 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
APBA3O96018 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
APBA3O96018 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
APBA3O96018 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
APBA3O96018 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
APBA3O96018 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
APBA3O96018 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
APBA3O96018 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
APBA3O96018 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
APBA3O96018 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
APBA3O96018 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
APBA3O96018 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
APBA3O96018 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
APBA3O96018 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
APBA3O96018 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
APBA3O96018 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
APBA3O96018 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
APBA3O96018 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
APBA3O96018 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
APBA3O96018 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
APBA3O96018 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
APBA3O96018 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
APBA3O96018 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
APBA3O96018 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
APBA3O96018 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
APBA3O96018 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
APBA3O96018 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
APBA3O96018 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
APBA3O96018 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
APBA3O96018 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
APBA3O96018 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
APBA3O96018 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
APBA3O96018 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
APBA3O96018 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.76■■■■□ 3.32
APBA3O96018 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
APBA3O96018 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
APBA3O96018 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
APBA3O96018 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
APBA3O96018 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
APBA3O96018 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
APBA3O96018 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
APBA3O96018 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
APBA3O96018 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
APBA3O96018 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
APBA3O96018 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
APBA3O96018 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
APBA3O96018 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
APBA3O96018 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
APBA3O96018 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
APBA3O96018 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
APBA3O96018 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
APBA3O96018 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
APBA3O96018 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
APBA3O96018 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
APBA3O96018 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
APBA3O96018 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
APBA3O96018 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
APBA3O96018 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
APBA3O96018 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
APBA3O96018 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
APBA3O96018 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
APBA3O96018 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
APBA3O96018 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
APBA3O96018 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
APBA3O96018 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
APBA3O96018 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
APBA3O96018 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
APBA3O96018 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
APBA3O96018 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
APBA3O96018 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
APBA3O96018 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
APBA3O96018 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms