Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRUB2O95900 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRUB2O95900 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TRUB2O95900 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRUB2O95900 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRUB2O95900 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRUB2O95900 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRUB2O95900 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRUB2O95900 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRUB2O95900 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRUB2O95900 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRUB2O95900 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRUB2O95900 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRUB2O95900 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRUB2O95900 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRUB2O95900 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRUB2O95900 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRUB2O95900 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRUB2O95900 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRUB2O95900 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRUB2O95900 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRUB2O95900 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRUB2O95900 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRUB2O95900 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRUB2O95900 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRUB2O95900 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRUB2O95900 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRUB2O95900 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRUB2O95900 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRUB2O95900 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRUB2O95900 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRUB2O95900 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRUB2O95900 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TRUB2O95900 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRUB2O95900 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRUB2O95900 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRUB2O95900 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRUB2O95900 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRUB2O95900 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRUB2O95900 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRUB2O95900 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRUB2O95900 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRUB2O95900 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRUB2O95900 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRUB2O95900 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRUB2O95900 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRUB2O95900 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRUB2O95900 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRUB2O95900 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRUB2O95900 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRUB2O95900 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRUB2O95900 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRUB2O95900 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRUB2O95900 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRUB2O95900 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRUB2O95900 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRUB2O95900 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRUB2O95900 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRUB2O95900 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRUB2O95900 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRUB2O95900 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRUB2O95900 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRUB2O95900 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRUB2O95900 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRUB2O95900 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRUB2O95900 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRUB2O95900 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRUB2O95900 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRUB2O95900 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRUB2O95900 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRUB2O95900 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRUB2O95900 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRUB2O95900 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRUB2O95900 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRUB2O95900 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRUB2O95900 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRUB2O95900 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRUB2O95900 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRUB2O95900 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRUB2O95900 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRUB2O95900 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRUB2O95900 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRUB2O95900 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRUB2O95900 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRUB2O95900 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRUB2O95900 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRUB2O95900 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRUB2O95900 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRUB2O95900 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRUB2O95900 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRUB2O95900 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRUB2O95900 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRUB2O95900 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRUB2O95900 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRUB2O95900 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRUB2O95900 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRUB2O95900 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRUB2O95900 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRUB2O95900 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRUB2O95900 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms