Protein–RNA interactions for Protein: O95758

PTBP3, Polypyrimidine tract-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP3O95758 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTBP3O95758 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTBP3O95758 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTBP3O95758 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTBP3O95758 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTBP3O95758 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTBP3O95758 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTBP3O95758 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTBP3O95758 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTBP3O95758 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTBP3O95758 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTBP3O95758 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTBP3O95758 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTBP3O95758 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTBP3O95758 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTBP3O95758 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTBP3O95758 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTBP3O95758 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTBP3O95758 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTBP3O95758 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTBP3O95758 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTBP3O95758 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTBP3O95758 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTBP3O95758 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTBP3O95758 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTBP3O95758 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTBP3O95758 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTBP3O95758 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTBP3O95758 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTBP3O95758 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTBP3O95758 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTBP3O95758 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTBP3O95758 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTBP3O95758 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTBP3O95758 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTBP3O95758 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTBP3O95758 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTBP3O95758 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTBP3O95758 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTBP3O95758 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTBP3O95758 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTBP3O95758 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTBP3O95758 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTBP3O95758 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTBP3O95758 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTBP3O95758 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTBP3O95758 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTBP3O95758 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTBP3O95758 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTBP3O95758 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTBP3O95758 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTBP3O95758 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTBP3O95758 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTBP3O95758 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTBP3O95758 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTBP3O95758 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTBP3O95758 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTBP3O95758 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTBP3O95758 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTBP3O95758 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTBP3O95758 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTBP3O95758 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTBP3O95758 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTBP3O95758 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTBP3O95758 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTBP3O95758 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTBP3O95758 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTBP3O95758 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTBP3O95758 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTBP3O95758 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTBP3O95758 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTBP3O95758 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTBP3O95758 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTBP3O95758 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTBP3O95758 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTBP3O95758 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTBP3O95758 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTBP3O95758 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTBP3O95758 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTBP3O95758 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTBP3O95758 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTBP3O95758 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTBP3O95758 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTBP3O95758 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTBP3O95758 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTBP3O95758 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTBP3O95758 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTBP3O95758 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTBP3O95758 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTBP3O95758 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTBP3O95758 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTBP3O95758 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTBP3O95758 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTBP3O95758 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTBP3O95758 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTBP3O95758 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTBP3O95758 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTBP3O95758 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTBP3O95758 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTBP3O95758 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms