Protein–RNA interactions for Protein: O95744

PMS2P2, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P2O95744 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS2P2O95744 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS2P2O95744 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS2P2O95744 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS2P2O95744 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS2P2O95744 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS2P2O95744 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS2P2O95744 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS2P2O95744 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PMS2P2O95744 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.8 ms