Protein–RNA interactions for Protein: O76009

KRT33A, Keratin, type I cuticular Ha3-I, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33AO76009 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT33AO76009 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT33AO76009 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT33AO76009 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT33AO76009 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT33AO76009 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT33AO76009 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT33AO76009 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT33AO76009 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT33AO76009 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT33AO76009 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT33AO76009 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT33AO76009 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT33AO76009 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT33AO76009 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT33AO76009 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT33AO76009 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT33AO76009 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT33AO76009 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT33AO76009 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT33AO76009 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT33AO76009 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT33AO76009 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT33AO76009 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT33AO76009 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT33AO76009 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT33AO76009 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT33AO76009 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT33AO76009 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT33AO76009 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT33AO76009 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT33AO76009 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT33AO76009 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT33AO76009 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT33AO76009 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT33AO76009 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT33AO76009 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT33AO76009 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT33AO76009 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT33AO76009 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT33AO76009 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT33AO76009 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT33AO76009 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT33AO76009 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT33AO76009 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT33AO76009 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT33AO76009 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT33AO76009 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT33AO76009 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT33AO76009 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT33AO76009 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT33AO76009 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT33AO76009 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT33AO76009 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT33AO76009 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT33AO76009 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT33AO76009 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT33AO76009 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT33AO76009 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT33AO76009 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT33AO76009 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT33AO76009 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT33AO76009 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT33AO76009 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT33AO76009 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT33AO76009 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT33AO76009 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT33AO76009 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT33AO76009 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT33AO76009 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT33AO76009 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT33AO76009 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT33AO76009 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT33AO76009 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT33AO76009 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT33AO76009 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT33AO76009 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT33AO76009 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT33AO76009 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT33AO76009 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT33AO76009 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT33AO76009 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT33AO76009 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT33AO76009 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT33AO76009 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT33AO76009 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT33AO76009 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT33AO76009 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT33AO76009 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT33AO76009 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT33AO76009 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT33AO76009 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT33AO76009 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT33AO76009 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT33AO76009 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT33AO76009 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT33AO76009 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT33AO76009 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT33AO76009 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT33AO76009 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms