Protein–RNA interactions for Protein: O75971

SNAPC5, snRNA-activating protein complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC5O75971 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAPC5O75971 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAPC5O75971 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAPC5O75971 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAPC5O75971 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAPC5O75971 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAPC5O75971 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAPC5O75971 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAPC5O75971 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAPC5O75971 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAPC5O75971 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNAPC5O75971 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAPC5O75971 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAPC5O75971 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAPC5O75971 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAPC5O75971 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAPC5O75971 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAPC5O75971 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAPC5O75971 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAPC5O75971 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAPC5O75971 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAPC5O75971 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAPC5O75971 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAPC5O75971 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAPC5O75971 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAPC5O75971 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAPC5O75971 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAPC5O75971 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAPC5O75971 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAPC5O75971 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAPC5O75971 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAPC5O75971 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAPC5O75971 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAPC5O75971 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAPC5O75971 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAPC5O75971 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAPC5O75971 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAPC5O75971 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAPC5O75971 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAPC5O75971 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAPC5O75971 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAPC5O75971 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAPC5O75971 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAPC5O75971 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAPC5O75971 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAPC5O75971 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAPC5O75971 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAPC5O75971 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAPC5O75971 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAPC5O75971 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAPC5O75971 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAPC5O75971 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAPC5O75971 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNAPC5O75971 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAPC5O75971 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAPC5O75971 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAPC5O75971 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAPC5O75971 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAPC5O75971 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAPC5O75971 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAPC5O75971 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAPC5O75971 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAPC5O75971 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAPC5O75971 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAPC5O75971 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAPC5O75971 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAPC5O75971 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAPC5O75971 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAPC5O75971 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAPC5O75971 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAPC5O75971 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAPC5O75971 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAPC5O75971 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAPC5O75971 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAPC5O75971 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAPC5O75971 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAPC5O75971 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAPC5O75971 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAPC5O75971 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAPC5O75971 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAPC5O75971 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAPC5O75971 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAPC5O75971 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAPC5O75971 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAPC5O75971 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAPC5O75971 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAPC5O75971 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAPC5O75971 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAPC5O75971 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAPC5O75971 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAPC5O75971 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAPC5O75971 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAPC5O75971 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNAPC5O75971 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAPC5O75971 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAPC5O75971 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAPC5O75971 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAPC5O75971 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAPC5O75971 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAPC5O75971 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms