Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
EIF3JO75822 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
EIF3JO75822 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
EIF3JO75822 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
EIF3JO75822 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
EIF3JO75822 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
EIF3JO75822 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
EIF3JO75822 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
EIF3JO75822 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
EIF3JO75822 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EIF3JO75822 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EIF3JO75822 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
EIF3JO75822 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EIF3JO75822 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
EIF3JO75822 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
EIF3JO75822 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
EIF3JO75822 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
EIF3JO75822 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
EIF3JO75822 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
EIF3JO75822 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
EIF3JO75822 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EIF3JO75822 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EIF3JO75822 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
EIF3JO75822 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
EIF3JO75822 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
EIF3JO75822 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
EIF3JO75822 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
EIF3JO75822 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
EIF3JO75822 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
EIF3JO75822 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EIF3JO75822 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
EIF3JO75822 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
EIF3JO75822 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
EIF3JO75822 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EIF3JO75822 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
EIF3JO75822 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EIF3JO75822 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
EIF3JO75822 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
EIF3JO75822 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
EIF3JO75822 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
EIF3JO75822 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
EIF3JO75822 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
EIF3JO75822 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EIF3JO75822 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EIF3JO75822 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
EIF3JO75822 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EIF3JO75822 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
EIF3JO75822 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EIF3JO75822 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
EIF3JO75822 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
EIF3JO75822 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
EIF3JO75822 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
EIF3JO75822 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
EIF3JO75822 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
EIF3JO75822 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
EIF3JO75822 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
EIF3JO75822 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
EIF3JO75822 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
EIF3JO75822 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
EIF3JO75822 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EIF3JO75822 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
EIF3JO75822 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
EIF3JO75822 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
EIF3JO75822 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
EIF3JO75822 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
EIF3JO75822 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
EIF3JO75822 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
EIF3JO75822 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
EIF3JO75822 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
EIF3JO75822 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
EIF3JO75822 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EIF3JO75822 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
EIF3JO75822 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EIF3JO75822 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EIF3JO75822 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EIF3JO75822 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EIF3JO75822 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EIF3JO75822 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EIF3JO75822 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EIF3JO75822 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EIF3JO75822 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EIF3JO75822 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
EIF3JO75822 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
EIF3JO75822 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EIF3JO75822 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EIF3JO75822 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
EIF3JO75822 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EIF3JO75822 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EIF3JO75822 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EIF3JO75822 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
EIF3JO75822 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EIF3JO75822 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EIF3JO75822 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EIF3JO75822 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
EIF3JO75822 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EIF3JO75822 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
EIF3JO75822 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EIF3JO75822 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EIF3JO75822 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EIF3JO75822 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms