Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCATO75600 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCATO75600 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCATO75600 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GCATO75600 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GCATO75600 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GCATO75600 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCATO75600 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCATO75600 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCATO75600 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCATO75600 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCATO75600 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCATO75600 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCATO75600 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCATO75600 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCATO75600 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCATO75600 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCATO75600 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCATO75600 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCATO75600 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCATO75600 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCATO75600 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GCATO75600 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCATO75600 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCATO75600 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCATO75600 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GCATO75600 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCATO75600 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCATO75600 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCATO75600 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GCATO75600 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCATO75600 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCATO75600 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCATO75600 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCATO75600 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCATO75600 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GCATO75600 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCATO75600 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCATO75600 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCATO75600 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCATO75600 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCATO75600 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCATO75600 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCATO75600 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCATO75600 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCATO75600 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCATO75600 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCATO75600 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCATO75600 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCATO75600 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCATO75600 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCATO75600 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCATO75600 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCATO75600 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCATO75600 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCATO75600 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCATO75600 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCATO75600 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCATO75600 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GCATO75600 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GCATO75600 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCATO75600 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCATO75600 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GCATO75600 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GCATO75600 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCATO75600 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCATO75600 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GCATO75600 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GCATO75600 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GCATO75600 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GCATO75600 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GCATO75600 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCATO75600 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCATO75600 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCATO75600 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCATO75600 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCATO75600 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCATO75600 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCATO75600 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCATO75600 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCATO75600 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCATO75600 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCATO75600 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCATO75600 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCATO75600 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCATO75600 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCATO75600 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCATO75600 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCATO75600 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCATO75600 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GCATO75600 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCATO75600 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCATO75600 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCATO75600 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCATO75600 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GCATO75600 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCATO75600 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCATO75600 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCATO75600 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GCATO75600 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms