Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PMPCBO75439 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PMPCBO75439 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PMPCBO75439 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PMPCBO75439 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PMPCBO75439 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PMPCBO75439 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PMPCBO75439 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PMPCBO75439 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PMPCBO75439 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PMPCBO75439 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PMPCBO75439 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PMPCBO75439 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PMPCBO75439 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PMPCBO75439 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PMPCBO75439 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PMPCBO75439 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PMPCBO75439 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PMPCBO75439 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PMPCBO75439 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PMPCBO75439 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PMPCBO75439 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PMPCBO75439 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PMPCBO75439 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PMPCBO75439 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PMPCBO75439 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PMPCBO75439 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PMPCBO75439 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PMPCBO75439 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PMPCBO75439 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PMPCBO75439 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PMPCBO75439 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PMPCBO75439 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PMPCBO75439 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PMPCBO75439 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PMPCBO75439 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PMPCBO75439 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PMPCBO75439 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PMPCBO75439 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PMPCBO75439 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PMPCBO75439 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PMPCBO75439 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PMPCBO75439 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PMPCBO75439 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PMPCBO75439 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PMPCBO75439 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PMPCBO75439 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PMPCBO75439 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PMPCBO75439 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PMPCBO75439 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PMPCBO75439 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PMPCBO75439 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PMPCBO75439 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMPCBO75439 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMPCBO75439 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMPCBO75439 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMPCBO75439 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMPCBO75439 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMPCBO75439 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PMPCBO75439 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PMPCBO75439 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PMPCBO75439 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PMPCBO75439 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PMPCBO75439 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PMPCBO75439 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PMPCBO75439 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PMPCBO75439 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PMPCBO75439 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PMPCBO75439 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PMPCBO75439 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PMPCBO75439 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PMPCBO75439 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PMPCBO75439 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PMPCBO75439 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PMPCBO75439 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PMPCBO75439 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PMPCBO75439 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PMPCBO75439 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PMPCBO75439 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PMPCBO75439 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PMPCBO75439 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PMPCBO75439 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PMPCBO75439 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PMPCBO75439 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PMPCBO75439 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PMPCBO75439 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PMPCBO75439 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PMPCBO75439 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PMPCBO75439 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PMPCBO75439 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PMPCBO75439 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PMPCBO75439 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PMPCBO75439 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PMPCBO75439 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PMPCBO75439 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PMPCBO75439 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PMPCBO75439 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PMPCBO75439 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PMPCBO75439 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PMPCBO75439 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms