Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
BRD4O60885 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
BRD4O60885 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
BRD4O60885 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
BRD4O60885 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
BRD4O60885 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
BRD4O60885 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
BRD4O60885 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
BRD4O60885 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
BRD4O60885 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
BRD4O60885 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
BRD4O60885 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
BRD4O60885 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
BRD4O60885 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
BRD4O60885 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
BRD4O60885 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
BRD4O60885 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
BRD4O60885 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
BRD4O60885 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
BRD4O60885 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
BRD4O60885 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
BRD4O60885 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
BRD4O60885 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
BRD4O60885 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
BRD4O60885 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
BRD4O60885 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
BRD4O60885 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
BRD4O60885 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
BRD4O60885 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
BRD4O60885 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
BRD4O60885 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
BRD4O60885 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
BRD4O60885 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
BRD4O60885 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
BRD4O60885 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
BRD4O60885 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
BRD4O60885 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
BRD4O60885 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
BRD4O60885 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
BRD4O60885 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
BRD4O60885 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
BRD4O60885 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
BRD4O60885 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
BRD4O60885 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
BRD4O60885 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
BRD4O60885 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
BRD4O60885 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
BRD4O60885 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
BRD4O60885 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
BRD4O60885 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
BRD4O60885 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
BRD4O60885 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
BRD4O60885 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
BRD4O60885 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
BRD4O60885 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
BRD4O60885 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
BRD4O60885 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
BRD4O60885 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
BRD4O60885 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
BRD4O60885 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
BRD4O60885 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
BRD4O60885 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
BRD4O60885 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
BRD4O60885 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
BRD4O60885 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
BRD4O60885 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
BRD4O60885 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
BRD4O60885 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
BRD4O60885 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
BRD4O60885 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
BRD4O60885 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
BRD4O60885 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
BRD4O60885 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
BRD4O60885 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
BRD4O60885 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
BRD4O60885 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
BRD4O60885 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
BRD4O60885 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
BRD4O60885 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
BRD4O60885 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
BRD4O60885 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
BRD4O60885 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
BRD4O60885 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
BRD4O60885 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
BRD4O60885 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
BRD4O60885 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
BRD4O60885 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
BRD4O60885 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
BRD4O60885 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
BRD4O60885 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
BRD4O60885 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
BRD4O60885 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
BRD4O60885 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.57
BRD4O60885 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
BRD4O60885 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
BRD4O60885 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
BRD4O60885 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
BRD4O60885 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
BRD4O60885 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
BRD4O60885 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms