Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEMFO60524 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEMFO60524 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
NEMFO60524 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEMFO60524 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEMFO60524 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEMFO60524 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEMFO60524 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEMFO60524 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEMFO60524 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEMFO60524 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NEMFO60524 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NEMFO60524 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NEMFO60524 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEMFO60524 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
NEMFO60524 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEMFO60524 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NEMFO60524 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEMFO60524 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEMFO60524 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEMFO60524 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEMFO60524 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEMFO60524 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEMFO60524 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEMFO60524 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEMFO60524 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEMFO60524 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEMFO60524 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEMFO60524 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEMFO60524 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEMFO60524 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEMFO60524 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEMFO60524 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEMFO60524 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEMFO60524 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEMFO60524 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NEMFO60524 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEMFO60524 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEMFO60524 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEMFO60524 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEMFO60524 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NEMFO60524 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEMFO60524 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEMFO60524 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEMFO60524 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEMFO60524 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEMFO60524 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEMFO60524 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEMFO60524 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEMFO60524 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEMFO60524 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEMFO60524 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEMFO60524 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEMFO60524 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEMFO60524 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
NEMFO60524 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NEMFO60524 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEMFO60524 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEMFO60524 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEMFO60524 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEMFO60524 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEMFO60524 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEMFO60524 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEMFO60524 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEMFO60524 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEMFO60524 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEMFO60524 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEMFO60524 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEMFO60524 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEMFO60524 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NEMFO60524 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NEMFO60524 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
NEMFO60524 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
NEMFO60524 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEMFO60524 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEMFO60524 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NEMFO60524 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NEMFO60524 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEMFO60524 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NEMFO60524 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NEMFO60524 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NEMFO60524 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NEMFO60524 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NEMFO60524 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEMFO60524 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEMFO60524 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEMFO60524 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEMFO60524 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEMFO60524 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEMFO60524 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEMFO60524 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NEMFO60524 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
NEMFO60524 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NEMFO60524 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEMFO60524 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEMFO60524 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEMFO60524 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEMFO60524 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NEMFO60524 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEMFO60524 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms