Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AIREO43918 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AIREO43918 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AIREO43918 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AIREO43918 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AIREO43918 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AIREO43918 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AIREO43918 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AIREO43918 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AIREO43918 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AIREO43918 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AIREO43918 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AIREO43918 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AIREO43918 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AIREO43918 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AIREO43918 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AIREO43918 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIREO43918 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AIREO43918 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AIREO43918 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AIREO43918 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AIREO43918 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AIREO43918 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AIREO43918 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AIREO43918 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AIREO43918 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AIREO43918 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AIREO43918 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIREO43918 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIREO43918 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AIREO43918 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AIREO43918 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AIREO43918 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AIREO43918 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AIREO43918 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AIREO43918 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AIREO43918 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AIREO43918 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AIREO43918 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AIREO43918 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AIREO43918 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AIREO43918 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AIREO43918 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AIREO43918 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AIREO43918 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AIREO43918 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AIREO43918 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AIREO43918 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AIREO43918 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AIREO43918 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AIREO43918 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AIREO43918 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AIREO43918 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AIREO43918 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AIREO43918 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AIREO43918 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AIREO43918 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AIREO43918 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AIREO43918 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AIREO43918 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AIREO43918 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AIREO43918 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AIREO43918 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AIREO43918 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AIREO43918 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIREO43918 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIREO43918 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIREO43918 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIREO43918 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIREO43918 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIREO43918 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIREO43918 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIREO43918 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIREO43918 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AIREO43918 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AIREO43918 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AIREO43918 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AIREO43918 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AIREO43918 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AIREO43918 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AIREO43918 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AIREO43918 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AIREO43918 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AIREO43918 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AIREO43918 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AIREO43918 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AIREO43918 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AIREO43918 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AIREO43918 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AIREO43918 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AIREO43918 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AIREO43918 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AIREO43918 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AIREO43918 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AIREO43918 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AIREO43918 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AIREO43918 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
AIREO43918 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AIREO43918 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AIREO43918 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms