Protein–RNA interactions for Protein: O43325

LYRM1, LYR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM1O43325 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYRM1O43325 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LYRM1O43325 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LYRM1O43325 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYRM1O43325 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYRM1O43325 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYRM1O43325 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYRM1O43325 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYRM1O43325 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYRM1O43325 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYRM1O43325 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYRM1O43325 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYRM1O43325 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYRM1O43325 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYRM1O43325 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYRM1O43325 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYRM1O43325 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYRM1O43325 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYRM1O43325 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms