Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRTM2O43300 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRTM2O43300 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRTM2O43300 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRTM2O43300 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRTM2O43300 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRTM2O43300 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRTM2O43300 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRTM2O43300 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRTM2O43300 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRTM2O43300 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRTM2O43300 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRTM2O43300 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRTM2O43300 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRTM2O43300 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRTM2O43300 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRTM2O43300 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRTM2O43300 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRTM2O43300 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRTM2O43300 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRTM2O43300 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRTM2O43300 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRTM2O43300 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRTM2O43300 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRTM2O43300 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRTM2O43300 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRTM2O43300 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRTM2O43300 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRTM2O43300 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRTM2O43300 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRTM2O43300 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRTM2O43300 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRTM2O43300 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRTM2O43300 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRTM2O43300 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRTM2O43300 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRTM2O43300 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRTM2O43300 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRTM2O43300 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRTM2O43300 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRTM2O43300 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRTM2O43300 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRTM2O43300 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRTM2O43300 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRTM2O43300 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRTM2O43300 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRTM2O43300 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRTM2O43300 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRTM2O43300 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRTM2O43300 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRTM2O43300 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRTM2O43300 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRTM2O43300 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRTM2O43300 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRTM2O43300 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRTM2O43300 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRTM2O43300 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRTM2O43300 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRTM2O43300 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRTM2O43300 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRTM2O43300 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRTM2O43300 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRTM2O43300 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRTM2O43300 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRTM2O43300 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRTM2O43300 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRTM2O43300 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRTM2O43300 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRTM2O43300 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRTM2O43300 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRTM2O43300 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRTM2O43300 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRTM2O43300 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRTM2O43300 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRTM2O43300 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRTM2O43300 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRTM2O43300 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRTM2O43300 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRTM2O43300 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRTM2O43300 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRTM2O43300 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRTM2O43300 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRTM2O43300 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRTM2O43300 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRTM2O43300 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRTM2O43300 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRTM2O43300 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRTM2O43300 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRTM2O43300 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRTM2O43300 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRTM2O43300 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRTM2O43300 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRTM2O43300 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRTM2O43300 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRTM2O43300 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRTM2O43300 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRTM2O43300 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRTM2O43300 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRTM2O43300 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRTM2O43300 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms