Protein–RNA interactions for Protein: O15480

MAGEB3, Melanoma-associated antigen B3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEB3O15480 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAGEB3O15480 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAGEB3O15480 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAGEB3O15480 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAGEB3O15480 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAGEB3O15480 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAGEB3O15480 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAGEB3O15480 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAGEB3O15480 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAGEB3O15480 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAGEB3O15480 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGEB3O15480 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAGEB3O15480 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAGEB3O15480 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAGEB3O15480 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEB3O15480 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEB3O15480 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGEB3O15480 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGEB3O15480 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEB3O15480 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEB3O15480 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEB3O15480 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEB3O15480 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEB3O15480 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEB3O15480 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGEB3O15480 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGEB3O15480 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEB3O15480 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEB3O15480 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEB3O15480 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEB3O15480 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEB3O15480 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEB3O15480 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAGEB3O15480 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEB3O15480 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEB3O15480 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEB3O15480 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEB3O15480 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEB3O15480 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEB3O15480 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEB3O15480 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEB3O15480 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEB3O15480 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEB3O15480 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEB3O15480 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEB3O15480 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEB3O15480 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEB3O15480 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEB3O15480 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEB3O15480 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEB3O15480 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEB3O15480 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEB3O15480 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEB3O15480 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEB3O15480 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEB3O15480 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEB3O15480 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEB3O15480 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEB3O15480 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEB3O15480 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAGEB3O15480 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEB3O15480 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEB3O15480 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEB3O15480 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEB3O15480 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEB3O15480 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEB3O15480 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEB3O15480 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEB3O15480 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEB3O15480 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEB3O15480 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEB3O15480 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEB3O15480 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEB3O15480 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEB3O15480 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEB3O15480 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEB3O15480 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEB3O15480 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEB3O15480 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEB3O15480 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEB3O15480 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEB3O15480 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEB3O15480 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEB3O15480 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEB3O15480 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEB3O15480 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEB3O15480 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEB3O15480 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEB3O15480 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEB3O15480 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEB3O15480 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEB3O15480 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEB3O15480 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEB3O15480 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEB3O15480 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEB3O15480 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEB3O15480 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEB3O15480 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEB3O15480 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEB3O15480 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms