Protein–RNA interactions for Protein: O15318

POLR3G, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3GO15318 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3GO15318 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3GO15318 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3GO15318 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3GO15318 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3GO15318 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3GO15318 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3GO15318 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3GO15318 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3GO15318 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3GO15318 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3GO15318 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3GO15318 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3GO15318 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3GO15318 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3GO15318 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3GO15318 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3GO15318 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLR3GO15318 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3GO15318 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3GO15318 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3GO15318 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3GO15318 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3GO15318 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3GO15318 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3GO15318 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3GO15318 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3GO15318 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3GO15318 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3GO15318 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3GO15318 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3GO15318 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3GO15318 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3GO15318 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3GO15318 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3GO15318 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3GO15318 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3GO15318 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3GO15318 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3GO15318 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3GO15318 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3GO15318 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3GO15318 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3GO15318 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3GO15318 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3GO15318 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3GO15318 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3GO15318 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3GO15318 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3GO15318 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3GO15318 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3GO15318 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3GO15318 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR3GO15318 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR3GO15318 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR3GO15318 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR3GO15318 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3GO15318 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR3GO15318 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3GO15318 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3GO15318 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3GO15318 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR3GO15318 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3GO15318 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3GO15318 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3GO15318 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3GO15318 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3GO15318 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3GO15318 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3GO15318 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR3GO15318 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3GO15318 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR3GO15318 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR3GO15318 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR3GO15318 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR3GO15318 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR3GO15318 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR3GO15318 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR3GO15318 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLR3GO15318 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3GO15318 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR3GO15318 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR3GO15318 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR3GO15318 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR3GO15318 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR3GO15318 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR3GO15318 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR3GO15318 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR3GO15318 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR3GO15318 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR3GO15318 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR3GO15318 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR3GO15318 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR3GO15318 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR3GO15318 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR3GO15318 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR3GO15318 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
POLR3GO15318 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR3GO15318 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR3GO15318 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms