Protein–RNA interactions for Protein: O15027

SEC16A, Protein transport protein Sec16A, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16AO15027 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC16AO15027 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC16AO15027 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC16AO15027 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC16AO15027 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC16AO15027 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC16AO15027 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC16AO15027 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC16AO15027 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC16AO15027 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC16AO15027 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC16AO15027 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC16AO15027 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC16AO15027 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC16AO15027 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC16AO15027 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC16AO15027 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC16AO15027 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC16AO15027 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC16AO15027 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC16AO15027 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC16AO15027 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC16AO15027 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC16AO15027 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC16AO15027 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC16AO15027 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC16AO15027 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC16AO15027 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC16AO15027 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC16AO15027 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC16AO15027 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC16AO15027 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC16AO15027 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC16AO15027 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC16AO15027 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC16AO15027 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC16AO15027 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC16AO15027 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC16AO15027 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC16AO15027 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC16AO15027 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC16AO15027 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC16AO15027 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC16AO15027 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC16AO15027 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC16AO15027 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC16AO15027 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC16AO15027 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC16AO15027 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC16AO15027 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC16AO15027 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC16AO15027 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC16AO15027 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC16AO15027 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC16AO15027 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC16AO15027 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC16AO15027 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC16AO15027 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC16AO15027 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC16AO15027 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC16AO15027 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC16AO15027 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC16AO15027 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC16AO15027 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC16AO15027 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC16AO15027 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC16AO15027 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC16AO15027 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC16AO15027 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC16AO15027 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC16AO15027 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC16AO15027 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms