Protein–RNA interactions for Protein: O14830

PPEF2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF2O14830 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPEF2O14830 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPEF2O14830 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPEF2O14830 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPEF2O14830 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPEF2O14830 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPEF2O14830 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPEF2O14830 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PPEF2O14830 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPEF2O14830 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPEF2O14830 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPEF2O14830 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPEF2O14830 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPEF2O14830 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPEF2O14830 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPEF2O14830 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPEF2O14830 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPEF2O14830 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPEF2O14830 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPEF2O14830 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PPEF2O14830 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPEF2O14830 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PPEF2O14830 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PPEF2O14830 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPEF2O14830 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPEF2O14830 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPEF2O14830 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PPEF2O14830 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPEF2O14830 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPEF2O14830 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPEF2O14830 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPEF2O14830 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPEF2O14830 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PPEF2O14830 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPEF2O14830 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPEF2O14830 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPEF2O14830 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPEF2O14830 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPEF2O14830 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PPEF2O14830 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPEF2O14830 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPEF2O14830 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPEF2O14830 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPEF2O14830 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPEF2O14830 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPEF2O14830 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PPEF2O14830 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPEF2O14830 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPEF2O14830 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPEF2O14830 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPEF2O14830 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPEF2O14830 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPEF2O14830 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPEF2O14830 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPEF2O14830 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPEF2O14830 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPEF2O14830 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPEF2O14830 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PPEF2O14830 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPEF2O14830 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPEF2O14830 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPEF2O14830 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPEF2O14830 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PPEF2O14830 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPEF2O14830 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPEF2O14830 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPEF2O14830 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPEF2O14830 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPEF2O14830 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPEF2O14830 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPEF2O14830 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPEF2O14830 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PPEF2O14830 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPEF2O14830 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPEF2O14830 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPEF2O14830 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPEF2O14830 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPEF2O14830 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPEF2O14830 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPEF2O14830 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPEF2O14830 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPEF2O14830 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPEF2O14830 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPEF2O14830 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPEF2O14830 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPEF2O14830 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPEF2O14830 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPEF2O14830 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPEF2O14830 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPEF2O14830 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPEF2O14830 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPEF2O14830 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPEF2O14830 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPEF2O14830 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PPEF2O14830 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPEF2O14830 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPEF2O14830 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPEF2O14830 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPEF2O14830 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPEF2O14830 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms