Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAMP3O14828 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAMP3O14828 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAMP3O14828 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAMP3O14828 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAMP3O14828 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAMP3O14828 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAMP3O14828 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAMP3O14828 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAMP3O14828 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAMP3O14828 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAMP3O14828 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAMP3O14828 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAMP3O14828 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAMP3O14828 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SCAMP3O14828 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCAMP3O14828 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAMP3O14828 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAMP3O14828 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAMP3O14828 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAMP3O14828 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAMP3O14828 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAMP3O14828 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAMP3O14828 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAMP3O14828 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAMP3O14828 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAMP3O14828 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAMP3O14828 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAMP3O14828 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAMP3O14828 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAMP3O14828 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAMP3O14828 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAMP3O14828 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAMP3O14828 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAMP3O14828 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAMP3O14828 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAMP3O14828 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAMP3O14828 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAMP3O14828 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAMP3O14828 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAMP3O14828 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAMP3O14828 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCAMP3O14828 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCAMP3O14828 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAMP3O14828 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAMP3O14828 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAMP3O14828 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAMP3O14828 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAMP3O14828 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAMP3O14828 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAMP3O14828 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAMP3O14828 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAMP3O14828 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAMP3O14828 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAMP3O14828 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAMP3O14828 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAMP3O14828 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAMP3O14828 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAMP3O14828 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAMP3O14828 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAMP3O14828 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAMP3O14828 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAMP3O14828 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAMP3O14828 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAMP3O14828 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAMP3O14828 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAMP3O14828 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAMP3O14828 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAMP3O14828 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAMP3O14828 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAMP3O14828 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAMP3O14828 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAMP3O14828 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAMP3O14828 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAMP3O14828 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAMP3O14828 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAMP3O14828 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAMP3O14828 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAMP3O14828 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAMP3O14828 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAMP3O14828 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAMP3O14828 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAMP3O14828 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAMP3O14828 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAMP3O14828 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAMP3O14828 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAMP3O14828 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAMP3O14828 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAMP3O14828 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAMP3O14828 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAMP3O14828 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAMP3O14828 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAMP3O14828 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAMP3O14828 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAMP3O14828 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAMP3O14828 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAMP3O14828 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAMP3O14828 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAMP3O14828 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAMP3O14828 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms