Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDSP2O14595 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDSP2O14595 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTDSP2O14595 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTDSP2O14595 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDSP2O14595 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDSP2O14595 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDSP2O14595 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDSP2O14595 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDSP2O14595 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDSP2O14595 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDSP2O14595 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSP2O14595 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSP2O14595 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSP2O14595 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSP2O14595 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSP2O14595 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSP2O14595 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSP2O14595 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSP2O14595 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDSP2O14595 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSP2O14595 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSP2O14595 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSP2O14595 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSP2O14595 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDSP2O14595 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDSP2O14595 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDSP2O14595 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSP2O14595 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDSP2O14595 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDSP2O14595 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSP2O14595 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSP2O14595 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSP2O14595 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSP2O14595 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSP2O14595 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSP2O14595 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSP2O14595 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSP2O14595 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSP2O14595 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSP2O14595 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTDSP2O14595 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSP2O14595 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSP2O14595 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSP2O14595 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSP2O14595 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSP2O14595 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSP2O14595 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSP2O14595 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSP2O14595 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSP2O14595 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTDSP2O14595 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSP2O14595 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTDSP2O14595 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTDSP2O14595 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTDSP2O14595 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTDSP2O14595 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSP2O14595 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTDSP2O14595 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTDSP2O14595 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTDSP2O14595 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTDSP2O14595 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTDSP2O14595 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CTDSP2O14595 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSP2O14595 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSP2O14595 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSP2O14595 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSP2O14595 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSP2O14595 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSP2O14595 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSP2O14595 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSP2O14595 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSP2O14595 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSP2O14595 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSP2O14595 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDSP2O14595 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSP2O14595 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSP2O14595 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSP2O14595 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSP2O14595 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSP2O14595 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDSP2O14595 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTDSP2O14595 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTDSP2O14595 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSP2O14595 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSP2O14595 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTDSP2O14595 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTDSP2O14595 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSP2O14595 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSP2O14595 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSP2O14595 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSP2O14595 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSP2O14595 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSP2O14595 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSP2O14595 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSP2O14595 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSP2O14595 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSP2O14595 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSP2O14595 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSP2O14595 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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