Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAFD1O14545 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAFD1O14545 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAFD1O14545 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAFD1O14545 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAFD1O14545 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAFD1O14545 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAFD1O14545 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAFD1O14545 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAFD1O14545 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAFD1O14545 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAFD1O14545 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAFD1O14545 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAFD1O14545 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAFD1O14545 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAFD1O14545 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAFD1O14545 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAFD1O14545 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAFD1O14545 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAFD1O14545 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAFD1O14545 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAFD1O14545 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAFD1O14545 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAFD1O14545 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAFD1O14545 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAFD1O14545 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAFD1O14545 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAFD1O14545 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAFD1O14545 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAFD1O14545 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAFD1O14545 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAFD1O14545 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAFD1O14545 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAFD1O14545 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAFD1O14545 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAFD1O14545 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAFD1O14545 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAFD1O14545 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAFD1O14545 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAFD1O14545 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAFD1O14545 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAFD1O14545 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRAFD1O14545 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAFD1O14545 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAFD1O14545 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAFD1O14545 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAFD1O14545 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAFD1O14545 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAFD1O14545 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAFD1O14545 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAFD1O14545 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAFD1O14545 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAFD1O14545 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAFD1O14545 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAFD1O14545 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAFD1O14545 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAFD1O14545 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAFD1O14545 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAFD1O14545 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAFD1O14545 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAFD1O14545 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAFD1O14545 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAFD1O14545 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAFD1O14545 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAFD1O14545 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAFD1O14545 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAFD1O14545 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAFD1O14545 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAFD1O14545 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAFD1O14545 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAFD1O14545 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAFD1O14545 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAFD1O14545 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAFD1O14545 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAFD1O14545 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAFD1O14545 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAFD1O14545 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAFD1O14545 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAFD1O14545 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAFD1O14545 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAFD1O14545 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAFD1O14545 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAFD1O14545 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAFD1O14545 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAFD1O14545 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAFD1O14545 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAFD1O14545 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAFD1O14545 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAFD1O14545 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAFD1O14545 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAFD1O14545 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAFD1O14545 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAFD1O14545 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAFD1O14545 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAFD1O14545 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAFD1O14545 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAFD1O14545 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAFD1O14545 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAFD1O14545 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAFD1O14545 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms