Protein–RNA interactions for Protein: O00548

DLL1, Delta-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL1O00548 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DLL1O00548 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DLL1O00548 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DLL1O00548 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DLL1O00548 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DLL1O00548 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DLL1O00548 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DLL1O00548 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DLL1O00548 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DLL1O00548 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DLL1O00548 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
DLL1O00548 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DLL1O00548 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DLL1O00548 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DLL1O00548 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DLL1O00548 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DLL1O00548 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
DLL1O00548 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DLL1O00548 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
DLL1O00548 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DLL1O00548 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DLL1O00548 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DLL1O00548 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DLL1O00548 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DLL1O00548 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DLL1O00548 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DLL1O00548 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
DLL1O00548 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DLL1O00548 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
DLL1O00548 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DLL1O00548 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
DLL1O00548 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DLL1O00548 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DLL1O00548 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DLL1O00548 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DLL1O00548 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DLL1O00548 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DLL1O00548 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DLL1O00548 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DLL1O00548 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DLL1O00548 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DLL1O00548 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DLL1O00548 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DLL1O00548 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DLL1O00548 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DLL1O00548 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DLL1O00548 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DLL1O00548 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DLL1O00548 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DLL1O00548 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DLL1O00548 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DLL1O00548 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DLL1O00548 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DLL1O00548 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DLL1O00548 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DLL1O00548 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DLL1O00548 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DLL1O00548 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DLL1O00548 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DLL1O00548 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DLL1O00548 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
DLL1O00548 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DLL1O00548 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DLL1O00548 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DLL1O00548 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DLL1O00548 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DLL1O00548 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
DLL1O00548 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DLL1O00548 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DLL1O00548 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DLL1O00548 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DLL1O00548 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DLL1O00548 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DLL1O00548 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DLL1O00548 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DLL1O00548 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DLL1O00548 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DLL1O00548 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DLL1O00548 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DLL1O00548 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DLL1O00548 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DLL1O00548 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DLL1O00548 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DLL1O00548 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
DLL1O00548 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DLL1O00548 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DLL1O00548 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DLL1O00548 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DLL1O00548 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DLL1O00548 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DLL1O00548 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DLL1O00548 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DLL1O00548 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DLL1O00548 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DLL1O00548 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DLL1O00548 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
DLL1O00548 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DLL1O00548 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DLL1O00548 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DLL1O00548 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms