Protein–RNA interactions for Protein: O00548

DLL1, Delta-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL1O00548 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
DLL1O00548 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
DLL1O00548 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
DLL1O00548 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
DLL1O00548 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
DLL1O00548 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
DLL1O00548 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
DLL1O00548 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
DLL1O00548 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
DLL1O00548 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
DLL1O00548 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
DLL1O00548 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
DLL1O00548 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
DLL1O00548 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
DLL1O00548 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
DLL1O00548 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
DLL1O00548 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
DLL1O00548 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
DLL1O00548 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
DLL1O00548 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DLL1O00548 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
DLL1O00548 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DLL1O00548 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DLL1O00548 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
DLL1O00548 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DLL1O00548 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DLL1O00548 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
DLL1O00548 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
DLL1O00548 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
DLL1O00548 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
DLL1O00548 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
DLL1O00548 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
DLL1O00548 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
DLL1O00548 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
DLL1O00548 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DLL1O00548 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
DLL1O00548 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
DLL1O00548 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
DLL1O00548 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
DLL1O00548 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
DLL1O00548 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
DLL1O00548 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DLL1O00548 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
DLL1O00548 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DLL1O00548 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
DLL1O00548 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
DLL1O00548 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
DLL1O00548 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
DLL1O00548 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
DLL1O00548 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
DLL1O00548 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
DLL1O00548 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
DLL1O00548 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
DLL1O00548 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
DLL1O00548 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DLL1O00548 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DLL1O00548 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DLL1O00548 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
DLL1O00548 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
DLL1O00548 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
DLL1O00548 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DLL1O00548 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
DLL1O00548 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
DLL1O00548 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DLL1O00548 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DLL1O00548 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
DLL1O00548 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
DLL1O00548 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DLL1O00548 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
DLL1O00548 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
DLL1O00548 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
DLL1O00548 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
DLL1O00548 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DLL1O00548 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DLL1O00548 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DLL1O00548 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DLL1O00548 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DLL1O00548 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
DLL1O00548 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
DLL1O00548 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DLL1O00548 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
DLL1O00548 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
DLL1O00548 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DLL1O00548 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DLL1O00548 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DLL1O00548 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
DLL1O00548 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DLL1O00548 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
DLL1O00548 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DLL1O00548 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
DLL1O00548 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
DLL1O00548 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DLL1O00548 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DLL1O00548 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DLL1O00548 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DLL1O00548 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
DLL1O00548 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
DLL1O00548 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
DLL1O00548 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
DLL1O00548 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms