Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PIK3CDO00329 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PIK3CDO00329 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PIK3CDO00329 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PIK3CDO00329 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PIK3CDO00329 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PIK3CDO00329 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PIK3CDO00329 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PIK3CDO00329 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PIK3CDO00329 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PIK3CDO00329 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PIK3CDO00329 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PIK3CDO00329 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PIK3CDO00329 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PIK3CDO00329 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PIK3CDO00329 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PIK3CDO00329 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PIK3CDO00329 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PIK3CDO00329 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
PIK3CDO00329 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PIK3CDO00329 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PIK3CDO00329 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PIK3CDO00329 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PIK3CDO00329 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PIK3CDO00329 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PIK3CDO00329 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PIK3CDO00329 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PIK3CDO00329 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PIK3CDO00329 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PIK3CDO00329 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PIK3CDO00329 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PIK3CDO00329 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PIK3CDO00329 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PIK3CDO00329 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PIK3CDO00329 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PIK3CDO00329 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PIK3CDO00329 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PIK3CDO00329 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PIK3CDO00329 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PIK3CDO00329 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PIK3CDO00329 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PIK3CDO00329 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PIK3CDO00329 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PIK3CDO00329 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PIK3CDO00329 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PIK3CDO00329 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PIK3CDO00329 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PIK3CDO00329 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PIK3CDO00329 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PIK3CDO00329 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PIK3CDO00329 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PIK3CDO00329 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PIK3CDO00329 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PIK3CDO00329 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PIK3CDO00329 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PIK3CDO00329 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PIK3CDO00329 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PIK3CDO00329 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PIK3CDO00329 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PIK3CDO00329 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PIK3CDO00329 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PIK3CDO00329 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PIK3CDO00329 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PIK3CDO00329 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PIK3CDO00329 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PIK3CDO00329 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PIK3CDO00329 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PIK3CDO00329 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PIK3CDO00329 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PIK3CDO00329 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PIK3CDO00329 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PIK3CDO00329 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PIK3CDO00329 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PIK3CDO00329 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PIK3CDO00329 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PIK3CDO00329 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PIK3CDO00329 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PIK3CDO00329 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PIK3CDO00329 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PIK3CDO00329 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PIK3CDO00329 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PIK3CDO00329 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PIK3CDO00329 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PIK3CDO00329 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PIK3CDO00329 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PIK3CDO00329 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PIK3CDO00329 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PIK3CDO00329 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PIK3CDO00329 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PIK3CDO00329 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PIK3CDO00329 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PIK3CDO00329 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PIK3CDO00329 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PIK3CDO00329 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PIK3CDO00329 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PIK3CDO00329 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PIK3CDO00329 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PIK3CDO00329 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PIK3CDO00329 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PIK3CDO00329 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms