Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TULP2O00295 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP2O00295 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TULP2O00295 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TULP2O00295 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP2O00295 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TULP2O00295 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TULP2O00295 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TULP2O00295 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TULP2O00295 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TULP2O00295 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TULP2O00295 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TULP2O00295 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP2O00295 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP2O00295 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TULP2O00295 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TULP2O00295 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TULP2O00295 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TULP2O00295 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TULP2O00295 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TULP2O00295 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TULP2O00295 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TULP2O00295 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TULP2O00295 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP2O00295 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP2O00295 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP2O00295 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP2O00295 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP2O00295 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP2O00295 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TULP2O00295 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TULP2O00295 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TULP2O00295 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TULP2O00295 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP2O00295 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TULP2O00295 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TULP2O00295 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TULP2O00295 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TULP2O00295 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TULP2O00295 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TULP2O00295 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TULP2O00295 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TULP2O00295 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP2O00295 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP2O00295 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP2O00295 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP2O00295 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP2O00295 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP2O00295 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TULP2O00295 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TULP2O00295 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TULP2O00295 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TULP2O00295 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TULP2O00295 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TULP2O00295 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TULP2O00295 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TULP2O00295 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TULP2O00295 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TULP2O00295 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TULP2O00295 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TULP2O00295 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TULP2O00295 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP2O00295 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TULP2O00295 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP2O00295 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP2O00295 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TULP2O00295 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP2O00295 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP2O00295 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TULP2O00295 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TULP2O00295 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TULP2O00295 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TULP2O00295 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP2O00295 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP2O00295 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP2O00295 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TULP2O00295 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TULP2O00295 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TULP2O00295 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TULP2O00295 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TULP2O00295 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TULP2O00295 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TULP2O00295 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TULP2O00295 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TULP2O00295 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TULP2O00295 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TULP2O00295 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TULP2O00295 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP2O00295 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TULP2O00295 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP2O00295 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP2O00295 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP2O00295 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP2O00295 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TULP2O00295 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TULP2O00295 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TULP2O00295 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TULP2O00295 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TULP2O00295 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TULP2O00295 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms