Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP99D6REC4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP99D6REC4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP99D6REC4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP99D6REC4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP99D6REC4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP99D6REC4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP99D6REC4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP99D6REC4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP99D6REC4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP99D6REC4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP99D6REC4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP99D6REC4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP99D6REC4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP99D6REC4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP99D6REC4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP99D6REC4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP99D6REC4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP99D6REC4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP99D6REC4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP99D6REC4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP99D6REC4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP99D6REC4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP99D6REC4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP99D6REC4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP99D6REC4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP99D6REC4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP99D6REC4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP99D6REC4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP99D6REC4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP99D6REC4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP99D6REC4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP99D6REC4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP99D6REC4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP99D6REC4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP99D6REC4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP99D6REC4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP99D6REC4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP99D6REC4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP99D6REC4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP99D6REC4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP99D6REC4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP99D6REC4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP99D6REC4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP99D6REC4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP99D6REC4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP99D6REC4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP99D6REC4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP99D6REC4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP99D6REC4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP99D6REC4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP99D6REC4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP99D6REC4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP99D6REC4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP99D6REC4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP99D6REC4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP99D6REC4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP99D6REC4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP99D6REC4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CFAP99D6REC4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP99D6REC4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP99D6REC4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP99D6REC4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP99D6REC4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP99D6REC4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP99D6REC4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP99D6REC4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP99D6REC4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP99D6REC4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP99D6REC4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP99D6REC4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP99D6REC4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP99D6REC4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP99D6REC4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP99D6REC4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP99D6REC4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP99D6REC4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP99D6REC4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP99D6REC4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP99D6REC4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP99D6REC4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP99D6REC4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP99D6REC4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP99D6REC4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP99D6REC4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP99D6REC4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP99D6REC4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP99D6REC4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP99D6REC4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP99D6REC4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP99D6REC4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP99D6REC4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP99D6REC4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP99D6REC4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP99D6REC4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP99D6REC4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP99D6REC4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP99D6REC4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CFAP99D6REC4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CFAP99D6REC4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms