Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRRM3A6NNA2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRRM3A6NNA2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SRRM3A6NNA2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRRM3A6NNA2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRRM3A6NNA2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRRM3A6NNA2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SRRM3A6NNA2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRRM3A6NNA2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SRRM3A6NNA2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRRM3A6NNA2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRRM3A6NNA2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRRM3A6NNA2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRRM3A6NNA2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRRM3A6NNA2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRRM3A6NNA2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRRM3A6NNA2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRRM3A6NNA2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRRM3A6NNA2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRRM3A6NNA2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRRM3A6NNA2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRRM3A6NNA2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRRM3A6NNA2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRRM3A6NNA2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SRRM3A6NNA2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRRM3A6NNA2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRRM3A6NNA2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRRM3A6NNA2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRRM3A6NNA2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRRM3A6NNA2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRRM3A6NNA2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRRM3A6NNA2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SRRM3A6NNA2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRRM3A6NNA2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRRM3A6NNA2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRRM3A6NNA2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SRRM3A6NNA2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRRM3A6NNA2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRRM3A6NNA2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRRM3A6NNA2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRRM3A6NNA2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRRM3A6NNA2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRRM3A6NNA2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRRM3A6NNA2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRRM3A6NNA2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRRM3A6NNA2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRRM3A6NNA2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRRM3A6NNA2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRRM3A6NNA2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRRM3A6NNA2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRRM3A6NNA2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRRM3A6NNA2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRRM3A6NNA2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRRM3A6NNA2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRRM3A6NNA2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRRM3A6NNA2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRRM3A6NNA2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRRM3A6NNA2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRRM3A6NNA2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRRM3A6NNA2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRRM3A6NNA2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRRM3A6NNA2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRRM3A6NNA2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRRM3A6NNA2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SRRM3A6NNA2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRRM3A6NNA2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRRM3A6NNA2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRRM3A6NNA2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRRM3A6NNA2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRRM3A6NNA2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRRM3A6NNA2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRRM3A6NNA2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRRM3A6NNA2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRRM3A6NNA2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SRRM3A6NNA2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRRM3A6NNA2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRRM3A6NNA2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SRRM3A6NNA2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SRRM3A6NNA2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRRM3A6NNA2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRRM3A6NNA2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRRM3A6NNA2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRRM3A6NNA2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRRM3A6NNA2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRRM3A6NNA2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRRM3A6NNA2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRRM3A6NNA2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRRM3A6NNA2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRRM3A6NNA2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRRM3A6NNA2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRRM3A6NNA2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRRM3A6NNA2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRRM3A6NNA2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SRRM3A6NNA2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRRM3A6NNA2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRRM3A6NNA2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SRRM3A6NNA2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SRRM3A6NNA2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRRM3A6NNA2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRRM3A6NNA2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms