Protein–RNA interactions for Protein: A6NM36

LRRC30, Leucine-rich repeat-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC30A6NM36 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC30A6NM36 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC30A6NM36 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC30A6NM36 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC30A6NM36 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC30A6NM36 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC30A6NM36 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC30A6NM36 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC30A6NM36 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC30A6NM36 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC30A6NM36 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC30A6NM36 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC30A6NM36 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC30A6NM36 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC30A6NM36 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC30A6NM36 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC30A6NM36 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC30A6NM36 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC30A6NM36 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC30A6NM36 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC30A6NM36 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC30A6NM36 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC30A6NM36 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC30A6NM36 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC30A6NM36 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC30A6NM36 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC30A6NM36 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC30A6NM36 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC30A6NM36 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC30A6NM36 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC30A6NM36 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC30A6NM36 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC30A6NM36 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC30A6NM36 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC30A6NM36 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC30A6NM36 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC30A6NM36 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC30A6NM36 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC30A6NM36 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC30A6NM36 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC30A6NM36 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC30A6NM36 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC30A6NM36 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC30A6NM36 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC30A6NM36 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC30A6NM36 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC30A6NM36 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC30A6NM36 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC30A6NM36 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC30A6NM36 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC30A6NM36 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC30A6NM36 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC30A6NM36 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC30A6NM36 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC30A6NM36 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC30A6NM36 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC30A6NM36 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC30A6NM36 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC30A6NM36 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC30A6NM36 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC30A6NM36 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC30A6NM36 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC30A6NM36 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC30A6NM36 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC30A6NM36 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC30A6NM36 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC30A6NM36 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC30A6NM36 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC30A6NM36 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC30A6NM36 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC30A6NM36 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC30A6NM36 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC30A6NM36 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC30A6NM36 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC30A6NM36 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC30A6NM36 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC30A6NM36 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC30A6NM36 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC30A6NM36 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC30A6NM36 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC30A6NM36 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC30A6NM36 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC30A6NM36 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC30A6NM36 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC30A6NM36 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC30A6NM36 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC30A6NM36 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC30A6NM36 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC30A6NM36 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC30A6NM36 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC30A6NM36 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC30A6NM36 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC30A6NM36 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC30A6NM36 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC30A6NM36 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC30A6NM36 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC30A6NM36 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC30A6NM36 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC30A6NM36 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC30A6NM36 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms