Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGPEP1LA6NFU8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGPEP1LA6NFU8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGPEP1LA6NFU8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PGPEP1LA6NFU8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PGPEP1LA6NFU8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PGPEP1LA6NFU8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PGPEP1LA6NFU8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PGPEP1LA6NFU8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PGPEP1LA6NFU8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PGPEP1LA6NFU8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PGPEP1LA6NFU8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PGPEP1LA6NFU8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PGPEP1LA6NFU8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGPEP1LA6NFU8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGPEP1LA6NFU8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGPEP1LA6NFU8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGPEP1LA6NFU8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGPEP1LA6NFU8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGPEP1LA6NFU8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGPEP1LA6NFU8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGPEP1LA6NFU8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGPEP1LA6NFU8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGPEP1LA6NFU8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGPEP1LA6NFU8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PGPEP1LA6NFU8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGPEP1LA6NFU8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGPEP1LA6NFU8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGPEP1LA6NFU8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGPEP1LA6NFU8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGPEP1LA6NFU8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PGPEP1LA6NFU8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGPEP1LA6NFU8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGPEP1LA6NFU8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGPEP1LA6NFU8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGPEP1LA6NFU8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGPEP1LA6NFU8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGPEP1LA6NFU8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGPEP1LA6NFU8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGPEP1LA6NFU8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGPEP1LA6NFU8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGPEP1LA6NFU8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGPEP1LA6NFU8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGPEP1LA6NFU8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGPEP1LA6NFU8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGPEP1LA6NFU8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGPEP1LA6NFU8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGPEP1LA6NFU8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGPEP1LA6NFU8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGPEP1LA6NFU8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGPEP1LA6NFU8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGPEP1LA6NFU8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGPEP1LA6NFU8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGPEP1LA6NFU8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PGPEP1LA6NFU8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PGPEP1LA6NFU8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGPEP1LA6NFU8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGPEP1LA6NFU8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGPEP1LA6NFU8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PGPEP1LA6NFU8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PGPEP1LA6NFU8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PGPEP1LA6NFU8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PGPEP1LA6NFU8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PGPEP1LA6NFU8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PGPEP1LA6NFU8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PGPEP1LA6NFU8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PGPEP1LA6NFU8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PGPEP1LA6NFU8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGPEP1LA6NFU8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms