Protein–RNA interactions for Protein: A3KN83

SBNO1, Protein strawberry notch homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1A3KN83 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SBNO1A3KN83 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SBNO1A3KN83 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SBNO1A3KN83 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SBNO1A3KN83 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SBNO1A3KN83 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SBNO1A3KN83 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
SBNO1A3KN83 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SBNO1A3KN83 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SBNO1A3KN83 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SBNO1A3KN83 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SBNO1A3KN83 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SBNO1A3KN83 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SBNO1A3KN83 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SBNO1A3KN83 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SBNO1A3KN83 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SBNO1A3KN83 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SBNO1A3KN83 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
SBNO1A3KN83 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SBNO1A3KN83 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SBNO1A3KN83 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SBNO1A3KN83 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SBNO1A3KN83 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SBNO1A3KN83 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SBNO1A3KN83 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SBNO1A3KN83 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SBNO1A3KN83 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SBNO1A3KN83 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SBNO1A3KN83 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SBNO1A3KN83 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SBNO1A3KN83 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SBNO1A3KN83 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SBNO1A3KN83 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SBNO1A3KN83 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SBNO1A3KN83 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SBNO1A3KN83 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SBNO1A3KN83 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SBNO1A3KN83 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SBNO1A3KN83 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SBNO1A3KN83 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
SBNO1A3KN83 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
SBNO1A3KN83 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SBNO1A3KN83 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SBNO1A3KN83 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
SBNO1A3KN83 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SBNO1A3KN83 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SBNO1A3KN83 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SBNO1A3KN83 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SBNO1A3KN83 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
SBNO1A3KN83 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
SBNO1A3KN83 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SBNO1A3KN83 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SBNO1A3KN83 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SBNO1A3KN83 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
SBNO1A3KN83 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SBNO1A3KN83 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SBNO1A3KN83 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
SBNO1A3KN83 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SBNO1A3KN83 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SBNO1A3KN83 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SBNO1A3KN83 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SBNO1A3KN83 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SBNO1A3KN83 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SBNO1A3KN83 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SBNO1A3KN83 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SBNO1A3KN83 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SBNO1A3KN83 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SBNO1A3KN83 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SBNO1A3KN83 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.57
SBNO1A3KN83 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SBNO1A3KN83 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SBNO1A3KN83 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SBNO1A3KN83 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SBNO1A3KN83 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SBNO1A3KN83 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
SBNO1A3KN83 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SBNO1A3KN83 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
SBNO1A3KN83 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
SBNO1A3KN83 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SBNO1A3KN83 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SBNO1A3KN83 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SBNO1A3KN83 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SBNO1A3KN83 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SBNO1A3KN83 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
SBNO1A3KN83 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SBNO1A3KN83 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SBNO1A3KN83 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SBNO1A3KN83 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
SBNO1A3KN83 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
SBNO1A3KN83 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SBNO1A3KN83 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SBNO1A3KN83 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
SBNO1A3KN83 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SBNO1A3KN83 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SBNO1A3KN83 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SBNO1A3KN83 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SBNO1A3KN83 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SBNO1A3KN83 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SBNO1A3KN83 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
SBNO1A3KN83 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms