Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PRV1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PRV1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A1W2PRV1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PRV1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PRV1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PRV1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PRV1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PRV1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PRV1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PRV1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PRV1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PRV1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PRV1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PRV1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PRV1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PRV1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PRV1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PRV1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PRV1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PRV1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PRV1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PRV1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PRV1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PRV1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PRV1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PRV1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PRV1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PRV1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PRV1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PRV1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PRV1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PRV1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PRV1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PRV1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PRV1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PRV1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PRV1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PRV1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PRV1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PRV1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PRV1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PRV1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PRV1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PRV1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PRV1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PRV1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PRV1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PRV1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PRV1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PRV1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PRV1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PRV1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PRV1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PRV1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PRV1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PRV1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PRV1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PRV1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PRV1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1W2PRV1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PRV1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PRV1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PRV1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PRV1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PRV1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PRV1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PRV1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PRV1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PRV1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PRV1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PRV1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PRV1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PRV1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PRV1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PRV1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
A0A1W2PRV1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PRV1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PRV1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PRV1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PRV1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PRV1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PRV1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PRV1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PRV1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PRV1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PRV1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PRV1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 337.8 ms