Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0J9YVX5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0J9YVX5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0J9YVX5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0J9YVX5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0J9YVX5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0J9YVX5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0J9YVX5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0J9YVX5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0J9YVX5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0J9YVX5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0J9YVX5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0J9YVX5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0J9YVX5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0J9YVX5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0J9YVX5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0J9YVX5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0J9YVX5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0J9YVX5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0J9YVX5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0J9YVX5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
A0A0J9YVX5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A0J9YVX5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A0J9YVX5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0J9YVX5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0J9YVX5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0J9YVX5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0J9YVX5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0J9YVX5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0J9YVX5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0J9YVX5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0J9YVX5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0J9YVX5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0J9YVX5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0J9YVX5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A0J9YVX5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A0J9YVX5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A0J9YVX5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A0J9YVX5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A0J9YVX5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0J9YVX5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0J9YVX5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0J9YVX5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0J9YVX5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0J9YVX5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0J9YVX5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0J9YVX5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0J9YVX5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0J9YVX5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0J9YVX5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0J9YVX5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0J9YVX5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0J9YVX5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
A0A0J9YVX5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0J9YVX5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0J9YVX5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0J9YVX5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0J9YVX5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0J9YVX5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0J9YVX5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0J9YVX5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0J9YVX5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0J9YVX5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0J9YVX5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0J9YVX5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0J9YVX5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0J9YVX5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0J9YVX5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0J9YVX5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0J9YVX5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0J9YVX5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0J9YVX5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0J9YVX5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0J9YVX5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0J9YVX5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0J9YVX5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0J9YVX5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
A0A0J9YVX5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A0J9YVX5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A0J9YVX5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A0J9YVX5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0J9YVX5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0J9YVX5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0J9YVX5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0J9YVX5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0J9YVX5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0J9YVX5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0J9YVX5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0J9YVX5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0J9YVX5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0J9YVX5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0J9YVX5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0J9YVX5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0J9YVX5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0J9YVX5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0J9YVX5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0J9YVX5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0J9YVX5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0J9YVX5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A0J9YVX5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms