Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SF12

CCDC163, Coiled-coil domain-containing 163, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC163A0A0D9SF12 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC163A0A0D9SF12 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC163A0A0D9SF12 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC163A0A0D9SF12 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC163A0A0D9SF12 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC163A0A0D9SF12 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC163A0A0D9SF12 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC163A0A0D9SF12 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC163A0A0D9SF12 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC163A0A0D9SF12 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC163A0A0D9SF12 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC163A0A0D9SF12 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC163A0A0D9SF12 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC163A0A0D9SF12 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC163A0A0D9SF12 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC163A0A0D9SF12 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC163A0A0D9SF12 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC163A0A0D9SF12 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC163A0A0D9SF12 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC163A0A0D9SF12 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC163A0A0D9SF12 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC163A0A0D9SF12 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC163A0A0D9SF12 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC163A0A0D9SF12 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC163A0A0D9SF12 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC163A0A0D9SF12 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC163A0A0D9SF12 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC163A0A0D9SF12 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC163A0A0D9SF12 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC163A0A0D9SF12 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC163A0A0D9SF12 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC163A0A0D9SF12 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC163A0A0D9SF12 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC163A0A0D9SF12 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC163A0A0D9SF12 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC163A0A0D9SF12 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC163A0A0D9SF12 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC163A0A0D9SF12 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC163A0A0D9SF12 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC163A0A0D9SF12 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC163A0A0D9SF12 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC163A0A0D9SF12 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC163A0A0D9SF12 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC163A0A0D9SF12 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC163A0A0D9SF12 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC163A0A0D9SF12 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC163A0A0D9SF12 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC163A0A0D9SF12 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC163A0A0D9SF12 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC163A0A0D9SF12 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC163A0A0D9SF12 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC163A0A0D9SF12 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC163A0A0D9SF12 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC163A0A0D9SF12 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC163A0A0D9SF12 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC163A0A0D9SF12 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC163A0A0D9SF12 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC163A0A0D9SF12 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC163A0A0D9SF12 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC163A0A0D9SF12 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC163A0A0D9SF12 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC163A0A0D9SF12 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC163A0A0D9SF12 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC163A0A0D9SF12 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC163A0A0D9SF12 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC163A0A0D9SF12 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC163A0A0D9SF12 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC163A0A0D9SF12 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC163A0A0D9SF12 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC163A0A0D9SF12 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC163A0A0D9SF12 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC163A0A0D9SF12 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC163A0A0D9SF12 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC163A0A0D9SF12 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC163A0A0D9SF12 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC163A0A0D9SF12 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC163A0A0D9SF12 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC163A0A0D9SF12 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC163A0A0D9SF12 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC163A0A0D9SF12 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC163A0A0D9SF12 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC163A0A0D9SF12 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC163A0A0D9SF12 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC163A0A0D9SF12 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC163A0A0D9SF12 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC163A0A0D9SF12 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC163A0A0D9SF12 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC163A0A0D9SF12 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC163A0A0D9SF12 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC163A0A0D9SF12 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC163A0A0D9SF12 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC163A0A0D9SF12 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC163A0A0D9SF12 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC163A0A0D9SF12 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC163A0A0D9SF12 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC163A0A0D9SF12 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC163A0A0D9SF12 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC163A0A0D9SF12 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC163A0A0D9SF12 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC163A0A0D9SF12 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms