Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J264

TRAV38-1, T-cell receptor alpha variable 38-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV38-1A0A0B4J264 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV38-1A0A0B4J264 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV38-1A0A0B4J264 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAV38-1A0A0B4J264 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAV38-1A0A0B4J264 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAV38-1A0A0B4J264 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAV38-1A0A0B4J264 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAV38-1A0A0B4J264 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAV38-1A0A0B4J264 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAV38-1A0A0B4J264 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAV38-1A0A0B4J264 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAV38-1A0A0B4J264 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAV38-1A0A0B4J264 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAV38-1A0A0B4J264 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAV38-1A0A0B4J264 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAV38-1A0A0B4J264 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAV38-1A0A0B4J264 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAV38-1A0A0B4J264 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAV38-1A0A0B4J264 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV38-1A0A0B4J264 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV38-1A0A0B4J264 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAV38-1A0A0B4J264 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAV38-1A0A0B4J264 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAV38-1A0A0B4J264 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAV38-1A0A0B4J264 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAV38-1A0A0B4J264 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAV38-1A0A0B4J264 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAV38-1A0A0B4J264 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAV38-1A0A0B4J264 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAV38-1A0A0B4J264 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAV38-1A0A0B4J264 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAV38-1A0A0B4J264 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAV38-1A0A0B4J264 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV38-1A0A0B4J264 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV38-1A0A0B4J264 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV38-1A0A0B4J264 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV38-1A0A0B4J264 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV38-1A0A0B4J264 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV38-1A0A0B4J264 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAV38-1A0A0B4J264 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAV38-1A0A0B4J264 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAV38-1A0A0B4J264 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAV38-1A0A0B4J264 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAV38-1A0A0B4J264 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAV38-1A0A0B4J264 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAV38-1A0A0B4J264 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAV38-1A0A0B4J264 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAV38-1A0A0B4J264 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAV38-1A0A0B4J264 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAV38-1A0A0B4J264 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAV38-1A0A0B4J264 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAV38-1A0A0B4J264 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAV38-1A0A0B4J264 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAV38-1A0A0B4J264 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAV38-1A0A0B4J264 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAV38-1A0A0B4J264 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAV38-1A0A0B4J264 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAV38-1A0A0B4J264 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAV38-1A0A0B4J264 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAV38-1A0A0B4J264 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAV38-1A0A0B4J264 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAV38-1A0A0B4J264 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAV38-1A0A0B4J264 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAV38-1A0A0B4J264 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAV38-1A0A0B4J264 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAV38-1A0A0B4J264 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAV38-1A0A0B4J264 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAV38-1A0A0B4J264 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAV38-1A0A0B4J264 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAV38-1A0A0B4J264 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAV38-1A0A0B4J264 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAV38-1A0A0B4J264 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAV38-1A0A0B4J264 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAV38-1A0A0B4J264 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAV38-1A0A0B4J264 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAV38-1A0A0B4J264 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAV38-1A0A0B4J264 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAV38-1A0A0B4J264 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAV38-1A0A0B4J264 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAV38-1A0A0B4J264 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAV38-1A0A0B4J264 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAV38-1A0A0B4J264 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAV38-1A0A0B4J264 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms