Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TNIKQ9UKE5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms