RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000374970.6

CERKL-204, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERKL, Length 1,392 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-204ENST00000374970 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.04■■■■■ 5.92
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CERKL-204ENST00000374970 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.61■■■■■ 4.57
CERKL-204ENST00000374970 NACADO15069 1562 aa43.55■■■■■ 4.56
CERKL-204ENST00000374970 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.38■■■■■ 4.53
CERKL-204ENST00000374970 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.36■■■■■ 4.53
CERKL-204ENST00000374970 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.31■■■■■ 4.52
CERKL-204ENST00000374970 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.1■■■■■ 4.49
CERKL-204ENST00000374970 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.62■■■■■ 4.41
CERKL-204ENST00000374970 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.3■■■■■ 4.36
CERKL-204ENST00000374970 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.29■■■■■ 4.36
CERKL-204ENST00000374970 SCRIBQ14160 1630 aa42.23■■■■■ 4.35
CERKL-204ENST00000374970 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.89■■■■■ 4.3
CERKL-204ENST00000374970 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.62■■■■■ 4.25
CERKL-204ENST00000374970 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
CERKL-204ENST00000374970 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.01■■■■■ 4.16
CERKL-204ENST00000374970 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.73■■■■■ 4.11
CERKL-204ENST00000374970 SMARCA4P51532 1647 aa40.4■■■■■ 4.06
CERKL-204ENST00000374970 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
CERKL-204ENST00000374970 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.19■■■■■ 4.02
CERKL-204ENST00000374970 NCAPD3P42695 1498 aa40.18■■■■■ 4.02
CERKL-204ENST00000374970 SMARCA2P51531 1590 aa40.14■■■■■ 4.02
CERKL-204ENST00000374970 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.1■■■■■ 4.01
CERKL-204ENST00000374970 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.04■■■■■ 4
CERKL-204ENST00000374970 HMGXB3Q12766 1538 aa40■■■■□ 3.99
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CERKL-204ENST00000374970 NESP48681 1621 aa39.2■■■■□ 3.87
CERKL-204ENST00000374970 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.14■■■■□ 3.86
CERKL-204ENST00000374970 ERCC6Q03468 1493 aa39.07■■■■□ 3.84
CERKL-204ENST00000374970 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.98■■■■□ 3.83
CERKL-204ENST00000374970 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.84■■■■□ 3.81
CERKL-204ENST00000374970 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.77■■■■□ 3.8
CERKL-204ENST00000374970 CFTRP13569 1480 aa38.76■■■■□ 3.8
CERKL-204ENST00000374970 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.76■■■■□ 3.79
CERKL-204ENST00000374970 CUX2O14529 1486 aa38.71■■■■□ 3.79
CERKL-204ENST00000374970 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.67■■■■□ 3.78
CERKL-204ENST00000374970 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.55■■■■□ 3.76
CERKL-204ENST00000374970 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.51■■■■□ 3.76
CERKL-204ENST00000374970 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.49■■■■□ 3.75
CERKL-204ENST00000374970 PRDM2Q13029 1718 aa38.48■■■■□ 3.75
CERKL-204ENST00000374970 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.47■■■■□ 3.75
CERKL-204ENST00000374970 WDR62O43379 1518 aa38.37■■■■□ 3.73
CERKL-204ENST00000374970 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.17■■■■□ 3.7
CERKL-204ENST00000374970 TOPBP1Q92547 1522 aa37.93■■■■□ 3.66
CERKL-204ENST00000374970 ABCC8Q09428 1581 aa37.92■■■■□ 3.66
CERKL-204ENST00000374970 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.89■■■■□ 3.66
CERKL-204ENST00000374970 IFT140Q96RY7 1462 aa37.7■■■■□ 3.63
CERKL-204ENST00000374970 CUX1P39880 1505 aa37.63■■■■□ 3.61
CERKL-204ENST00000374970 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
CERKL-204ENST00000374970 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
CERKL-204ENST00000374970 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
CERKL-204ENST00000374970 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.53■■■■□ 3.6
CERKL-204ENST00000374970 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.5■■■■□ 3.59
CERKL-204ENST00000374970 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.42■■■■□ 3.58
CERKL-204ENST00000374970 SOGA1O94964 1423 aa37.42■■■■□ 3.58
CERKL-204ENST00000374970 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
CERKL-204ENST00000374970 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.36■■■■□ 3.57
CERKL-204ENST00000374970 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.31■■■■□ 3.56
CERKL-204ENST00000374970 TOP2BQ02880 1626 aa37.3■■■■□ 3.56
CERKL-204ENST00000374970 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.29■■■■□ 3.56
CERKL-204ENST00000374970 SYNJ1O43426 1573 aa37.28■■■■□ 3.56
CERKL-204ENST00000374970 WDR97A6NE52 1622 aa37.26■■■■□ 3.55
CERKL-204ENST00000374970 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
CERKL-204ENST00000374970 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.16■■■■□ 3.54
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CERKL-204ENST00000374970 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.03■■■■□ 3.52
CERKL-204ENST00000374970 GRIN2BQ13224 1484 aa37.02■■■■□ 3.52
CERKL-204ENST00000374970 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.01■■■■□ 3.51
CERKL-204ENST00000374970 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.98■■■■□ 3.51
CERKL-204ENST00000374970 PBRM1Q86U86 1689 aa36.95■■■■□ 3.51
CERKL-204ENST00000374970 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
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CERKL-204ENST00000374970 FBLN2P98095 1184 aa36.8■■■■□ 3.48
CERKL-204ENST00000374970 SYNJ2O15056 1496 aa36.79■■■■□ 3.48
CERKL-204ENST00000374970 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
CERKL-204ENST00000374970 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.71■■■■□ 3.47
CERKL-204ENST00000374970 ADAMTS12P58397 1594 aa36.68■■■■□ 3.46
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CERKL-204ENST00000374970 KIF27Q86VH2 1401 aa36.58■■■■□ 3.45
CERKL-204ENST00000374970 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.55■■■■□ 3.44
CERKL-204ENST00000374970 GRIN2AQ12879 1464 aa36.55■■■■□ 3.44
CERKL-204ENST00000374970 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.49■■■■□ 3.43
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CERKL-204ENST00000374970 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.49■■■■□ 3.43
CERKL-204ENST00000374970 ARHGEF11O15085 1522 aa36.49■■■■□ 3.43
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CERKL-204ENST00000374970 NUP160Q12769 1436 aa36.4■■■■□ 3.42
CERKL-204ENST00000374970 TRIM41Q8WV44 630 aa36.38■■■■□ 3.41
CERKL-204ENST00000374970 CEP170Q5SW79 1584 aa36.38■■■■□ 3.41
CERKL-204ENST00000374970 CUL7Q14999 1698 aa36.37■■■■□ 3.41
CERKL-204ENST00000374970 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.21■■■■□ 3.39
CERKL-204ENST00000374970 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.2■■■■□ 3.39
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CERKL-204ENST00000374970 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.08■■■■□ 3.37
CERKL-204ENST00000374970 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.02■■■■□ 3.36
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