RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371417.3

ARRDC1-AS1-201, ARRDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ARRDC1-AS1, Length 1,409 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.84■■■■■ 5.89
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.73■■■■■ 4.91
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ABCC9O60706 1549 aa44.09■■■■■ 4.65
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.33■■■■■ 4.53
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.05■■■■■ 4.48
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.91■■■■■ 4.46
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NACADO15069 1562 aa42.83■■■■■ 4.45
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.81■■■■■ 4.44
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.7■■■■■ 4.43
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SCRIBQ14160 1630 aa41.83■■■■■ 4.29
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.76■■■■■ 4.28
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.43■■■■■ 4.22
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.42■■■■■ 4.22
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.35■■■■■ 4.21
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.33■■■■■ 4.05
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SMARCA4P51532 1647 aa40.06■■■■■ 4
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.98■■■■□ 3.99
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.91■■■■□ 3.98
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.84■■■■□ 3.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.67■■■■□ 3.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.66■■■■□ 3.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SMARCA2P51531 1590 aa39.63■■■■□ 3.93
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 WIZO95785 1651 aa39.59■■■■□ 3.93
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NCAPD3P42695 1498 aa39.53■■■■□ 3.92
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 HMGXB3Q12766 1538 aa39.39■■■■□ 3.9
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.37■■■■□ 3.89
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.75■■■■□ 3.79
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.42■■■■□ 3.74
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NESP48681 1621 aa38.38■■■■□ 3.73
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.35■■■■□ 3.73
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CFTRP13569 1480 aa38.35■■■■□ 3.73
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PRDM2Q13029 1718 aa38.09■■■■□ 3.69
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.07■■■■□ 3.69
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.97■■■■□ 3.67
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.93■■■■□ 3.66
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ERCC6Q03468 1493 aa37.92■■■■□ 3.66
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.84■■■■□ 3.65
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.65■■■■□ 3.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.6
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ABCC8Q09428 1581 aa37.56■■■■□ 3.6
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 WDR62O43379 1518 aa37.51■■■■□ 3.59
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.48■■■■□ 3.591e-6■■■■■ 58.5
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.47■■■■□ 3.59
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TOPBP1Q92547 1522 aa37.46■■■■□ 3.59
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CUX1P39880 1505 aa37.46■■■■□ 3.59
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SYNJ1O43426 1573 aa37.37■■■■□ 3.57
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TOP2BQ02880 1626 aa37.32■■■■□ 3.56
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.31■■■■□ 3.56
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CUX2O14529 1486 aa37.24■■■■□ 3.55
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.21■■■■□ 3.55
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.17■■■■□ 3.54
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TRIM41Q8WV44 630 aa37.12■■■■□ 3.53
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SOGA1O94964 1423 aa37.05■■■■□ 3.52
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.05■■■■□ 3.52
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 IFT140Q96RY7 1462 aa37.03■■■■□ 3.52
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.88■■■■□ 3.49
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 WDR97A6NE52 1622 aa36.86■■■■□ 3.49
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.72■■■■□ 3.472e-6■■□□□ 13.8
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.67■■■■□ 3.46
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KIF27Q86VH2 1401 aa36.63■■■■□ 3.45
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.63■■■■□ 3.45
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.57■■■■□ 3.45
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GRIN2BQ13224 1484 aa36.52■■■■□ 3.44
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PBRM1Q86U86 1689 aa36.5■■■■□ 3.43
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.44■■■■□ 3.42
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 IGF1RP08069 1367 aa36.42■■■■□ 3.42
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 EEA1Q15075 1411 aa36.41■■■■□ 3.42
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.38■■■■□ 3.41
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.29■■■■□ 3.4
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ADAMTS12P58397 1594 aa36.26■■■■□ 3.4
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CUL7Q14999 1698 aa36.25■■■■□ 3.39
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.23■■■■□ 3.39
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.21■■■■□ 3.39
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SYNJ2O15056 1496 aa36.2■■■■□ 3.38
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PRXQ9BXM0 1461 aa36.13■■■■□ 3.37
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FBLN2P98095 1184 aa36.13■■■■□ 3.37
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CHD1O14646 1710 aa36.09■■■■□ 3.37
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.07■■■■□ 3.37
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GRIN2AQ12879 1464 aa36.06■■■■□ 3.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KIF21BO75037 1637 aa35.99■■■■□ 3.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NUP160Q12769 1436 aa35.86■■■■□ 3.33
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 OSCARQ8IYS5 282 aa35.86■■■■□ 3.33
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CEP170Q5SW79 1584 aa35.86■■■■□ 3.33
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GOLGA3Q08378 1498 aa35.84■■■■□ 3.33
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.83■■■■□ 3.33
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.72■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.5 ms