Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.243e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 XRCC1-205ENST00000595789 1147 ntTSL 313.55□□□□□ -0.245e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 TARBP2-211ENST00000549572 1514 ntTSL 513.53□□□□□ -0.243e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 TARBP2-213ENST00000549679 1466 ntTSL 513.37□□□□□ -0.273e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 PLXNB2-204ENST00000427829 567 ntTSL 413.29□□□□□ -0.283e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.315e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 RAB35-203ENST00000538903 643 ntTSL 313.09□□□□□ -0.313e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.323e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 TARBP2-215ENST00000550407 1132 ntTSL 513.02□□□□□ -0.333e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 CYTH1-206ENST00000586299 4423 nt12.85□□□□□ -0.353e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 XRCC1-207ENST00000598165 913 ntTSL 312.76□□□□□ -0.375e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.393e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.43e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 TARBP2-217ENST00000551741 992 ntTSL 212.54□□□□□ -0.43e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.413e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.423e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.443e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.443e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 TARBP2-216ENST00000551157 1008 ntTSL 312.11□□□□□ -0.473e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 SAP130-204ENST00000424298 849 ntTSL 211.06□□□□□ -0.643e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 TARBP2-206ENST00000547064 759 ntTSL 310.77□□□□□ -0.693e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 ATXN7L2-205ENST00000497545 4375 ntTSL 210.44□□□□□ -0.743e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 UTP15-207ENST00000513824 577 ntTSL 410.38□□□□□ -0.753e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 CENPE-206ENST00000514974 581 ntTSL 510.32□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 CYTH1-205ENST00000586175 874 ntTSL 210.09□□□□□ -0.793e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 TARBP2-219ENST00000552817 668 ntTSL 39.98□□□□□ -0.813e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 IMMP2L-206ENST00000452753 421 ntTSL 59.69□□□□□ -0.863e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 MED13-204ENST00000581994 2213 nt9.69□□□□□ -0.863e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 PLCB3-203ENST00000536243 471 ntTSL 29.39□□□□□ -0.913e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 CYTH1-207ENST00000586430 573 ntTSL 38.97□□□□□ -0.973e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 TARBP2-208ENST00000547541 430 ntTSL 38.93□□□□□ -0.983e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 TANC1-201ENST00000263635 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.113e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.143e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 XRCC1-203ENST00000594107 586 ntTSL 27.82□□□□□ -1.165e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 UTP15-204ENST00000509005 2057 ntTSL 27.74□□□□□ -1.173e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 UTP15-202ENST00000508491 1828 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.183e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.233e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 LRP8-206ENST00000460214 775 ntTSL 37.14□□□□□ -1.273e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 HSPE1-202ENST00000409468 570 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.293e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.33e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 P4HA2-218ENST00000474628 743 ntTSL 26.93□□□□□ -1.33e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 KPNA6-203ENST00000469790 879 ntTSL 26.39□□□□□ -1.393e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 RERE-216ENST00000505225 533 ntTSL 26.27□□□□□ -1.413e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.433e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 TTK-203ENST00000430061 580 ntTSL 45.89□□□□□ -1.473e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 TTK-205ENST00000504040 569 ntTSL 25.89□□□□□ -1.473e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.483e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.523e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 MED13-206ENST00000583958 1068 ntTSL 1 (best)5.13□□□□□ -1.593e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 LRP6-203ENST00000538239 7812 ntTSL 1 (best)5.08□□□□□ -1.63e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.633e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.633e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 LRP8-210ENST00000481431 627 ntTSL 34.84□□□□□ -1.633e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 MYNN-205ENST00000602751 2630 ntTSL 1 (best)4.79□□□□□ -1.643e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.673e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 HSPE1-204ENST00000463841 700 ntTSL 24.28□□□□□ -1.723e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.743e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.753e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 MED13-202ENST00000578132 751 ntTSL 32.85□□□□□ -1.953e-9■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 PCBP2-218ENST00000550585 2543 ntTSL 59.29□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 PLXNA3-201ENST00000369682 10885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.654e-8■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 RCC1-209ENST00000430407 1121 ntTSL 516.06■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 RCC1-205ENST00000411533 1169 ntTSL 512.9□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 RCC1-206ENST00000419074 997 ntTSL 511.9□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 RCC1-208ENST00000429051 538 ntTSL 310.54□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 GPAT4-211ENST00000523906 664 ntTSL 59.96□□□□□ -0.826e-7■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 PROC-202ENST00000402125 779 ntTSL 216.6■□□□□ 0.252e-10■■■■■ 41.1
SF3B4Q15427 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.891e-11■■■■■ 41
SF3B4Q15427 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.171e-11■■■■■ 41
SF3B4Q15427 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.171e-11■■■■■ 41
SF3B4Q15427 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.291e-11■■■■■ 41
SF3B4Q15427 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.471e-11■■■■■ 41
SF3B4Q15427 ADD1-206ENST00000398129 3787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.711e-11■■■■■ 41
SF3B4Q15427 ADD1-210ENST00000503455 3206 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.711e-11■■■■■ 41
SF3B4Q15427 ADD1-217ENST00000513328 3107 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.721e-11■■■■■ 41
SF3B4Q15427 RBM22-204ENST00000520132 2067 ntTSL 28.91□□□□□ -0.981e-11■■■■■ 41
SF3B4Q15427 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.284e-8■■■■■ 41
SF3B4Q15427 D2HGDH-202ENST00000400769 2277 ntTSL 221.98■■□□□ 1.114e-8■■■■■ 41
SF3B4Q15427 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.884e-8■■■■■ 41
SF3B4Q15427 D2HGDH-206ENST00000436747 4549 ntTSL 1 (best)15.58■□□□□ 0.084e-8■■■■■ 41
SF3B4Q15427 ADD1-225ENST00000539149 460 ntTSL 213.77□□□□□ -0.211e-39■■■■■ 41
SF3B4Q15427 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.598e-8■■■■■ 41
SF3B4Q15427 PRICKLE3-203ENST00000432913 990 ntTSL 513.57□□□□□ -0.248e-8■■■■■ 41
SF3B4Q15427 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.388e-8■■■■■ 41
SF3B4Q15427 PRICKLE3-205ENST00000540849 2246 ntTSL 212.64□□□□□ -0.398e-8■■■■■ 41
SF3B4Q15427 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.719e-9■■■■■ 41
SF3B4Q15427 ABCD4-202ENST00000460308 1003 ntTSL 1 (best)19.46■□□□□ 0.715e-8■■■■■ 41
SF3B4Q15427 ABCD4-224ENST00000556119 838 ntTSL 512.12□□□□□ -0.475e-8■■■■■ 41
SF3B4Q15427 ABCD4-205ENST00000469672 966 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 41
SF3B4Q15427 ABCD4-227ENST00000557554 523 ntTSL 49.16□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 41
SF3B4Q15427 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.31□□□□□ -1.722e-14■■■■■ 41
SF3B4Q15427 LDLRAP1-206ENST00000485476 238 ntTSL 511.05□□□□□ -0.645e-7■■■■■ 41
SF3B4Q15427 ANKRD23-204ENST00000462692 857 ntTSL 514.54□□□□□ -0.081e-10■■■■■ 41
SF3B4Q15427 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.048e-9■■■■■ 40.9
SF3B4Q15427 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.38e-9■■■■■ 40.9
SF3B4Q15427 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.18e-9■■■■■ 40.9
SF3B4Q15427 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.298e-9■■■■■ 40.9
SF3B4Q15427 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.568e-9■■■■■ 40.9
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