RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513328.6

ADD1-217, Transcript of adducin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ADD1, Length 3,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADD1-217ENST00000513328 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.29■■□□□ 1.16
ADD1-217ENST00000513328 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.71■□□□□ 0.75
ADD1-217ENST00000513328 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.02■□□□□ 0.63
ADD1-217ENST00000513328 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.91■□□□□ 0.62
ADD1-217ENST00000513328 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
ADD1-217ENST00000513328 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.58■□□□□ 0.56
ADD1-217ENST00000513328 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.5■□□□□ 0.55
ADD1-217ENST00000513328 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
ADD1-217ENST00000513328 ABCC9O60706 1549 aa18.33■□□□□ 0.52
ADD1-217ENST00000513328 NACADO15069 1562 aa18.3■□□□□ 0.52
ADD1-217ENST00000513328 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.14■□□□□ 0.49
ADD1-217ENST00000513328 SLC24A1O60721 1099 aa18.03■□□□□ 0.48
ADD1-217ENST00000513328 SCRIBQ14160 1630 aa17.95■□□□□ 0.46
ADD1-217ENST00000513328 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.8■□□□□ 0.44
ADD1-217ENST00000513328 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
ADD1-217ENST00000513328 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.55■□□□□ 0.4
ADD1-217ENST00000513328 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.52■□□□□ 0.39
ADD1-217ENST00000513328 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
ADD1-217ENST00000513328 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.49■□□□□ 0.39
ADD1-217ENST00000513328 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.48■□□□□ 0.39
ADD1-217ENST00000513328 MYT1Q01538 1121 aa17.39■□□□□ 0.37
ADD1-217ENST00000513328 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.33■□□□□ 0.37
ADD1-217ENST00000513328 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
ADD1-217ENST00000513328 WIZO95785 1651 aa17.19■□□□□ 0.34
ADD1-217ENST00000513328 SMARCA4P51532 1647 aa17.13■□□□□ 0.33
ADD1-217ENST00000513328 TRIM41Q8WV44 630 aa17.11■□□□□ 0.33
ADD1-217ENST00000513328 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.09■□□□□ 0.33
ADD1-217ENST00000513328 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
ADD1-217ENST00000513328 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.03■□□□□ 0.32
ADD1-217ENST00000513328 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
ADD1-217ENST00000513328 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
ADD1-217ENST00000513328 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.98■□□□□ 0.31
ADD1-217ENST00000513328 SMARCA2P51531 1590 aa16.93■□□□□ 0.3
ADD1-217ENST00000513328 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
ADD1-217ENST00000513328 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.88■□□□□ 0.29
ADD1-217ENST00000513328 HMGXB3Q12766 1538 aa16.85■□□□□ 0.29
ADD1-217ENST00000513328 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.83■□□□□ 0.28
ADD1-217ENST00000513328 NCAPD3P42695 1498 aa16.81■□□□□ 0.28
ADD1-217ENST00000513328 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.78■□□□□ 0.28
ADD1-217ENST00000513328 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
ADD1-217ENST00000513328 ABCC8Q09428 1581 aa16.69■□□□□ 0.26
ADD1-217ENST00000513328 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
ADD1-217ENST00000513328 HRCP23327 699 aa16.65■□□□□ 0.26
ADD1-217ENST00000513328 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
ADD1-217ENST00000513328 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.57■□□□□ 0.24
ADD1-217ENST00000513328 APLP2Q06481 763 aa16.54■□□□□ 0.24
ADD1-217ENST00000513328 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.5■□□□□ 0.23
ADD1-217ENST00000513328 PRDM2Q13029 1718 aa16.5■□□□□ 0.23
ADD1-217ENST00000513328 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
ADD1-217ENST00000513328 SOGA1O94964 1423 aa16.48■□□□□ 0.23
ADD1-217ENST00000513328 ERICH6Q7L0X2 663 aa16.43■□□□□ 0.22
ADD1-217ENST00000513328 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
ADD1-217ENST00000513328 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
ADD1-217ENST00000513328 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.41■□□□□ 0.22
ADD1-217ENST00000513328 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.4■□□□□ 0.22
ADD1-217ENST00000513328 SYNJ1O43426 1573 aa16.35■□□□□ 0.21
ADD1-217ENST00000513328 CFTRP13569 1480 aa16.34■□□□□ 0.21
ADD1-217ENST00000513328 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.34■□□□□ 0.21
ADD1-217ENST00000513328 BCL11AQ9H165 835 aa16.33■□□□□ 0.21
ADD1-217ENST00000513328 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
ADD1-217ENST00000513328 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
ADD1-217ENST00000513328 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.25■□□□□ 0.19
ADD1-217ENST00000513328 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.25■□□□□ 0.19
ADD1-217ENST00000513328 EEA1Q15075 1411 aa16.25■□□□□ 0.19
ADD1-217ENST00000513328 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.19■□□□□ 0.18
ADD1-217ENST00000513328 CEP162Q5TB80 1403 aa16.17■□□□□ 0.18
ADD1-217ENST00000513328 TOP2BQ02880 1626 aa16.16■□□□□ 0.18
ADD1-217ENST00000513328 CUX1P39880 1505 aa16.16■□□□□ 0.18
ADD1-217ENST00000513328 GOLGA3Q08378 1498 aa16.15■□□□□ 0.18
ADD1-217ENST00000513328 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.15■□□□□ 0.18
ADD1-217ENST00000513328 NESP48681 1621 aa16.13■□□□□ 0.17
ADD1-217ENST00000513328 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.13■□□□□ 0.17
ADD1-217ENST00000513328 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.11■□□□□ 0.17
ADD1-217ENST00000513328 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.08■□□□□ 0.16
ADD1-217ENST00000513328 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.08■□□□□ 0.16
ADD1-217ENST00000513328 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.08■□□□□ 0.16
ADD1-217ENST00000513328 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.06■□□□□ 0.16
ADD1-217ENST00000513328 KIF27Q86VH2 1401 aa16.06■□□□□ 0.16
ADD1-217ENST00000513328 CUX2O14529 1486 aa16.02■□□□□ 0.15
ADD1-217ENST00000513328 CLIP1P30622 1438 aa16.01■□□□□ 0.15
ADD1-217ENST00000513328 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16■□□□□ 0.15
ADD1-217ENST00000513328 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.99■□□□□ 0.15
ADD1-217ENST00000513328 KIF21BO75037 1637 aa15.97■□□□□ 0.15
ADD1-217ENST00000513328 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ADD1-217ENST00000513328 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.93■□□□□ 0.14
ADD1-217ENST00000513328 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ADD1-217ENST00000513328 WDR62O43379 1518 aa15.92■□□□□ 0.14
ADD1-217ENST00000513328 PRXQ9BXM0 1461 aa15.91■□□□□ 0.14
ADD1-217ENST00000513328 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.91■□□□□ 0.14
ADD1-217ENST00000513328 IGF1RP08069 1367 aa15.9■□□□□ 0.14
ADD1-217ENST00000513328 TOPBP1Q92547 1522 aa15.89■□□□□ 0.13
ADD1-217ENST00000513328 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
ADD1-217ENST00000513328 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.87■□□□□ 0.13
ADD1-217ENST00000513328 WDR97A6NE52 1622 aa15.87■□□□□ 0.13
ADD1-217ENST00000513328 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
ADD1-217ENST00000513328 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
ADD1-217ENST00000513328 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
ADD1-217ENST00000513328 P3H3Q8IVL6 736 aa15.83■□□□□ 0.12
ADD1-217ENST00000513328 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.82■□□□□ 0.12
ADD1-217ENST00000513328 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms