RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398123.6

ADD1-204, Transcript of adducin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ADD1, Length 2,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADD1-204ENST00000398123 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.87■■■■□ 3.01
ADD1-204ENST00000398123 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.53■■■□□ 2.32
ADD1-204ENST00000398123 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
ADD1-204ENST00000398123 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.04■■■□□ 2.08
ADD1-204ENST00000398123 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.01■■■□□ 2.07
ADD1-204ENST00000398123 ABCC9O60706 1549 aa27.93■■■□□ 2.06
ADD1-204ENST00000398123 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.73■■■□□ 2.03
ADD1-204ENST00000398123 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.59■■■□□ 2.01
ADD1-204ENST00000398123 NACADO15069 1562 aa27.54■■■□□ 2
ADD1-204ENST00000398123 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.31■■□□□ 1.96
ADD1-204ENST00000398123 SCRIBQ14160 1630 aa27.13■■□□□ 1.93
ADD1-204ENST00000398123 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.62■■□□□ 1.85
ADD1-204ENST00000398123 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
ADD1-204ENST00000398123 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.41■■□□□ 1.82
ADD1-204ENST00000398123 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
ADD1-204ENST00000398123 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.28■■□□□ 1.8
ADD1-204ENST00000398123 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
ADD1-204ENST00000398123 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
ADD1-204ENST00000398123 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.14■■□□□ 1.77
ADD1-204ENST00000398123 SMARCA4P51532 1647 aa26.02■■□□□ 1.76
ADD1-204ENST00000398123 WIZO95785 1651 aa25.9■■□□□ 1.74
ADD1-204ENST00000398123 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.72■■□□□ 1.71
ADD1-204ENST00000398123 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
ADD1-204ENST00000398123 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
ADD1-204ENST00000398123 SMARCA2P51531 1590 aa25.63■■□□□ 1.69
ADD1-204ENST00000398123 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.62■■□□□ 1.69
ADD1-204ENST00000398123 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
ADD1-204ENST00000398123 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.44■■□□□ 1.66
ADD1-204ENST00000398123 NCAPD3P42695 1498 aa25.43■■□□□ 1.66
ADD1-204ENST00000398123 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.42■■□□□ 1.66
ADD1-204ENST00000398123 HMGXB3Q12766 1538 aa25.37■■□□□ 1.65
ADD1-204ENST00000398123 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.26■■□□□ 1.63
ADD1-204ENST00000398123 TRIM41Q8WV44 630 aa25.04■■□□□ 1.6
ADD1-204ENST00000398123 CFTRP13569 1480 aa24.85■■□□□ 1.57
ADD1-204ENST00000398123 ABCC8Q09428 1581 aa24.84■■□□□ 1.57
ADD1-204ENST00000398123 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.78■■□□□ 1.56
ADD1-204ENST00000398123 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
ADD1-204ENST00000398123 PRDM2Q13029 1718 aa24.64■■□□□ 1.54
ADD1-204ENST00000398123 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.59■■□□□ 1.53
ADD1-204ENST00000398123 SYNJ1O43426 1573 aa24.58■■□□□ 1.53
ADD1-204ENST00000398123 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.55■■□□□ 1.52
ADD1-204ENST00000398123 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
ADD1-204ENST00000398123 TOP2BQ02880 1626 aa24.52■■□□□ 1.52
ADD1-204ENST00000398123 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.49■■□□□ 1.51
ADD1-204ENST00000398123 NESP48681 1621 aa24.49■■□□□ 1.51
ADD1-204ENST00000398123 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.48■■□□□ 1.51
ADD1-204ENST00000398123 EEA1Q15075 1411 aa24.45■■□□□ 1.5
ADD1-204ENST00000398123 CUX1P39880 1505 aa24.44■■□□□ 1.5
ADD1-204ENST00000398123 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.44■■□□□ 1.5
ADD1-204ENST00000398123 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.41■■□□□ 1.5
ADD1-204ENST00000398123 SOGA1O94964 1423 aa24.4■■□□□ 1.5
ADD1-204ENST00000398123 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.34■■□□□ 1.49
ADD1-204ENST00000398123 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.29■■□□□ 1.48
ADD1-204ENST00000398123 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.28■■□□□ 1.48
ADD1-204ENST00000398123 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.26■■□□□ 1.47
ADD1-204ENST00000398123 TOPBP1Q92547 1522 aa24.21■■□□□ 1.47
ADD1-204ENST00000398123 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.2■■□□□ 1.46
ADD1-204ENST00000398123 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.16■■□□□ 1.46
ADD1-204ENST00000398123 KIF27Q86VH2 1401 aa24.16■■□□□ 1.46
ADD1-204ENST00000398123 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
ADD1-204ENST00000398123 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.15■■□□□ 1.46
ADD1-204ENST00000398123 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
ADD1-204ENST00000398123 GOLGA3Q08378 1498 aa24.07■■□□□ 1.44
ADD1-204ENST00000398123 CUX2O14529 1486 aa24.06■■□□□ 1.44
ADD1-204ENST00000398123 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.06■■□□□ 1.44
ADD1-204ENST00000398123 KIF21BO75037 1637 aa24.06■■□□□ 1.44
ADD1-204ENST00000398123 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.01■■□□□ 1.43
ADD1-204ENST00000398123 TNIKQ9UKE5 1360 aa24■■□□□ 1.43
ADD1-204ENST00000398123 ERCC6Q03468 1493 aa24■■□□□ 1.43
ADD1-204ENST00000398123 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.99■■□□□ 1.43
ADD1-204ENST00000398123 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
ADD1-204ENST00000398123 PRXQ9BXM0 1461 aa23.95■■□□□ 1.43
ADD1-204ENST00000398123 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.92■■□□□ 1.42
ADD1-204ENST00000398123 IGF1RP08069 1367 aa23.91■■□□□ 1.42
ADD1-204ENST00000398123 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.91■■□□□ 1.42
ADD1-204ENST00000398123 WDR62O43379 1518 aa23.91■■□□□ 1.42
ADD1-204ENST00000398123 WDR97A6NE52 1622 aa23.85■■□□□ 1.41
ADD1-204ENST00000398123 CEP162Q5TB80 1403 aa23.84■■□□□ 1.41
ADD1-204ENST00000398123 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
ADD1-204ENST00000398123 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.81■■□□□ 1.4
ADD1-204ENST00000398123 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
ADD1-204ENST00000398123 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
ADD1-204ENST00000398123 IFT140Q96RY7 1462 aa23.78■■□□□ 1.4
ADD1-204ENST00000398123 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.77■■□□□ 1.4
ADD1-204ENST00000398123 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.77■■□□□ 1.4
ADD1-204ENST00000398123 CUL7Q14999 1698 aa23.72■■□□□ 1.39
ADD1-204ENST00000398123 CLIP1P30622 1438 aa23.68■■□□□ 1.38
ADD1-204ENST00000398123 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.371e-6■■■■□ 21
ADD1-204ENST00000398123 GRIN2BQ13224 1484 aa23.6■■□□□ 1.37
ADD1-204ENST00000398123 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
ADD1-204ENST00000398123 PBRM1Q86U86 1689 aa23.57■■□□□ 1.36
ADD1-204ENST00000398123 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ADD1-204ENST00000398123 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.54■■□□□ 1.36
ADD1-204ENST00000398123 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ADD1-204ENST00000398123 ADAMTS12P58397 1594 aa23.47■■□□□ 1.35
ADD1-204ENST00000398123 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.47■■□□□ 1.35
ADD1-204ENST00000398123 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.41■■□□□ 1.34
ADD1-204ENST00000398123 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.41■■□□□ 1.34
ADD1-204ENST00000398123 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.4■■□□□ 1.34
ADD1-204ENST00000398123 ARAP1Q96P48 1450 aa23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms