Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERGIC2Q96RQ1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERGIC2Q96RQ1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERGIC2Q96RQ1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERGIC2Q96RQ1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERGIC2Q96RQ1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERGIC2Q96RQ1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERGIC2Q96RQ1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERGIC2Q96RQ1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERGIC2Q96RQ1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERGIC2Q96RQ1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERGIC2Q96RQ1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERGIC2Q96RQ1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ERGIC2Q96RQ1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERGIC2Q96RQ1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERGIC2Q96RQ1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERGIC2Q96RQ1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERGIC2Q96RQ1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
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