RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.75■■■■■ 5.72
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.59■■■■■ 4.73
HOXA4-201ENST00000360046 ABCC9O60706 1549 aa42.81■■■■■ 4.44
HOXA4-201ENST00000360046 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
HOXA4-201ENST00000360046 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.24■■■■■ 4.35
HOXA4-201ENST00000360046 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.97■■■■■ 4.31
HOXA4-201ENST00000360046 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.68■■■■■ 4.26
HOXA4-201ENST00000360046 NACADO15069 1562 aa41.63■■■■■ 4.26
HOXA4-201ENST00000360046 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.47■■■■■ 4.23
HOXA4-201ENST00000360046 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.02■■■■■ 4.16
HOXA4-201ENST00000360046 SCRIBQ14160 1630 aa40.92■■■■■ 4.14
HOXA4-201ENST00000360046 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.59■■■■■ 4.09
HOXA4-201ENST00000360046 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.25■■■■■ 4.03
HOXA4-201ENST00000360046 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.17■■■■■ 4.02
HOXA4-201ENST00000360046 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.47■■■■□ 3.91
HOXA4-201ENST00000360046 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.27■■■■□ 3.88
HOXA4-201ENST00000360046 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.19■■■■□ 3.86
HOXA4-201ENST00000360046 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.18■■■■□ 3.86
HOXA4-201ENST00000360046 SMARCA4P51532 1647 aa39.17■■■■□ 3.86
HOXA4-201ENST00000360046 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.13■■■■□ 3.85
HOXA4-201ENST00000360046 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.84
HOXA4-201ENST00000360046 WIZO95785 1651 aa38.87■■■■□ 3.81
HOXA4-201ENST00000360046 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.78■■■■□ 3.8
HOXA4-201ENST00000360046 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.69■■■■□ 3.78
HOXA4-201ENST00000360046 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.68■■■■□ 3.78
HOXA4-201ENST00000360046 SMARCA2P51531 1590 aa38.64■■■■□ 3.78
HOXA4-201ENST00000360046 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.63■■■■□ 3.78
HOXA4-201ENST00000360046 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
HOXA4-201ENST00000360046 NCAPD3P42695 1498 aa38.42■■■■□ 3.74
HOXA4-201ENST00000360046 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
HOXA4-201ENST00000360046 HMGXB3Q12766 1538 aa38.33■■■■□ 3.73
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.02■■■■□ 3.68
HOXA4-201ENST00000360046 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.42■■■■□ 3.58
HOXA4-201ENST00000360046 CFTRP13569 1480 aa37.38■■■■□ 3.57
HOXA4-201ENST00000360046 NESP48681 1621 aa37.32■■■■□ 3.56
HOXA4-201ENST00000360046 PRDM2Q13029 1718 aa37.26■■■■□ 3.56
HOXA4-201ENST00000360046 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.25■■■■□ 3.55
HOXA4-201ENST00000360046 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.16■■■■□ 3.54
HOXA4-201ENST00000360046 ABCC8Q09428 1581 aa37.07■■■■□ 3.52
HOXA4-201ENST00000360046 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.02■■■■□ 3.52
HOXA4-201ENST00000360046 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37■■■■□ 3.51
HOXA4-201ENST00000360046 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.89■■■■□ 3.5
HOXA4-201ENST00000360046 TRIM41Q8WV44 630 aa36.88■■■■□ 3.49
HOXA4-201ENST00000360046 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.85■■■■□ 3.49
HOXA4-201ENST00000360046 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.85■■■■□ 3.49
HOXA4-201ENST00000360046 ERCC6Q03468 1493 aa36.81■■■■□ 3.48
HOXA4-201ENST00000360046 SYNJ1O43426 1573 aa36.77■■■■□ 3.48
HOXA4-201ENST00000360046 CUX1P39880 1505 aa36.69■■■■□ 3.46
HOXA4-201ENST00000360046 TOP2BQ02880 1626 aa36.68■■■■□ 3.46
HOXA4-201ENST00000360046 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.66■■■■□ 3.46
HOXA4-201ENST00000360046 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.57■■■■□ 3.44
HOXA4-201ENST00000360046 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.56■■■■□ 3.44
HOXA4-201ENST00000360046 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
HOXA4-201ENST00000360046 TOPBP1Q92547 1522 aa36.52■■■■□ 3.44
HOXA4-201ENST00000360046 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
HOXA4-201ENST00000360046 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.39■■■■□ 3.42
HOXA4-201ENST00000360046 WDR62O43379 1518 aa36.37■■■■□ 3.41
HOXA4-201ENST00000360046 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
HOXA4-201ENST00000360046 SOGA1O94964 1423 aa36.21■■■■□ 3.39
HOXA4-201ENST00000360046 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.38
HOXA4-201ENST00000360046 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.17■■■■□ 3.38
HOXA4-201ENST00000360046 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.11■■■■□ 3.37
HOXA4-201ENST00000360046 CUX2O14529 1486 aa36.09■■■■□ 3.37
HOXA4-201ENST00000360046 EEA1Q15075 1411 aa36.06■■■■□ 3.36
HOXA4-201ENST00000360046 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.05■■■■□ 3.36
HOXA4-201ENST00000360046 WDR97A6NE52 1622 aa36.02■■■■□ 3.36
HOXA4-201ENST00000360046 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
HOXA4-201ENST00000360046 KIF27Q86VH2 1401 aa36.01■■■■□ 3.36
HOXA4-201ENST00000360046 IFT140Q96RY7 1462 aa36.01■■■■□ 3.35
HOXA4-201ENST00000360046 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
HOXA4-201ENST00000360046 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.89■■■■□ 3.34
HOXA4-201ENST00000360046 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.83■■■■□ 3.33
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.33
HOXA4-201ENST00000360046 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.79■■■■□ 3.32
HOXA4-201ENST00000360046 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.77■■■■□ 3.32
HOXA4-201ENST00000360046 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.72■■■■□ 3.31
HOXA4-201ENST00000360046 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.72■■■■□ 3.31
HOXA4-201ENST00000360046 IGF1RP08069 1367 aa35.69■■■■□ 3.3
HOXA4-201ENST00000360046 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
HOXA4-201ENST00000360046 PBRM1Q86U86 1689 aa35.66■■■■□ 3.3
HOXA4-201ENST00000360046 KIF21BO75037 1637 aa35.65■■■■□ 3.3
HOXA4-201ENST00000360046 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.63■■■■□ 3.29
HOXA4-201ENST00000360046 PRXQ9BXM0 1461 aa35.59■■■■□ 3.29
HOXA4-201ENST00000360046 GRIN2BQ13224 1484 aa35.59■■■■□ 3.29
HOXA4-201ENST00000360046 CUL7Q14999 1698 aa35.57■■■■□ 3.28
HOXA4-201ENST00000360046 GOLGA3Q08378 1498 aa35.56■■■■□ 3.28
HOXA4-201ENST00000360046 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.54■■■■□ 3.28
HOXA4-201ENST00000360046 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.52■■■■□ 3.28
HOXA4-201ENST00000360046 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.43■■■■□ 3.26
HOXA4-201ENST00000360046 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
HOXA4-201ENST00000360046 ADAMTS12P58397 1594 aa35.41■■■■□ 3.26
HOXA4-201ENST00000360046 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.36■■■■□ 3.25
HOXA4-201ENST00000360046 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
HOXA4-201ENST00000360046 FBLN2P98095 1184 aa35.29■■■■□ 3.24
HOXA4-201ENST00000360046 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.29■■■■□ 3.24
HOXA4-201ENST00000360046 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
HOXA4-201ENST00000360046 SYNJ2O15056 1496 aa35.23■■■■□ 3.23
HOXA4-201ENST00000360046 GRIN2AQ12879 1464 aa35.14■■■■□ 3.22
HOXA4-201ENST00000360046 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.12■■■■□ 3.21
HOXA4-201ENST00000360046 CEP162Q5TB80 1403 aa35.1■■■■□ 3.21
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